Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
Mindy1Q76LS9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Mindy1Q76LS9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Mindy1Q76LS9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Mindy1Q76LS9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Mindy1Q76LS9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Mindy1Q76LS9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Mindy1Q76LS9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Mindy1Q76LS9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Mindy1Q76LS9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Mindy1Q76LS9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Mindy1Q76LS9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Mindy1Q76LS9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Mindy1Q76LS9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Mindy1Q76LS9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Mindy1Q76LS9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Mindy1Q76LS9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Mindy1Q76LS9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Mindy1Q76LS9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Mindy1Q76LS9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Mindy1Q76LS9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Mindy1Q76LS9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Mindy1Q76LS9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Mindy1Q76LS9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Mindy1Q76LS9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Mindy1Q76LS9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Mindy1Q76LS9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Mindy1Q76LS9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Mindy1Q76LS9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Mindy1Q76LS9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Mindy1Q76LS9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Mindy1Q76LS9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Mindy1Q76LS9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Mindy1Q76LS9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Mindy1Q76LS9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Mindy1Q76LS9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Mindy1Q76LS9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Mindy1Q76LS9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Mindy1Q76LS9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Mindy1Q76LS9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Mindy1Q76LS9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Mindy1Q76LS9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Mindy1Q76LS9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Mindy1Q76LS9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Mindy1Q76LS9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Mindy1Q76LS9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Mindy1Q76LS9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Mindy1Q76LS9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Mindy1Q76LS9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Mindy1Q76LS9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Mindy1Q76LS9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Mindy1Q76LS9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Mindy1Q76LS9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Mindy1Q76LS9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Mindy1Q76LS9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Mindy1Q76LS9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Mindy1Q76LS9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Mindy1Q76LS9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Mindy1Q76LS9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Mindy1Q76LS9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Mindy1Q76LS9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Mindy1Q76LS9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Mindy1Q76LS9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Mindy1Q76LS9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Mindy1Q76LS9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Mindy1Q76LS9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Mindy1Q76LS9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Mindy1Q76LS9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Mindy1Q76LS9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Mindy1Q76LS9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Mindy1Q76LS9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Mindy1Q76LS9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Mindy1Q76LS9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Mindy1Q76LS9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Mindy1Q76LS9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Mindy1Q76LS9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Mindy1Q76LS9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Mindy1Q76LS9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Mindy1Q76LS9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Mindy1Q76LS9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Mindy1Q76LS9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Mindy1Q76LS9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Mindy1Q76LS9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Mindy1Q76LS9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Mindy1Q76LS9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Mindy1Q76LS9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Mindy1Q76LS9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Mindy1Q76LS9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Mindy1Q76LS9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Mindy1Q76LS9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Mindy1Q76LS9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Mindy1Q76LS9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Mindy1Q76LS9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Mindy1Q76LS9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Mindy1Q76LS9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Mindy1Q76LS9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Mindy1Q76LS9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Mindy1Q76LS9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Mindy1Q76LS9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Mindy1Q76LS9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms