Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
Cnga4Q3UW12 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,19■■■■□ 3,06
Cnga4Q3UW12 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,93■■■■□ 3,02
Cnga4Q3UW12 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Cnga4Q3UW12 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,01■■■□□ 2,87
Cnga4Q3UW12 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Cnga4Q3UW12 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Cnga4Q3UW12 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Cnga4Q3UW12 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,7
Cnga4Q3UW12 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Cnga4Q3UW12 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,64
Cnga4Q3UW12 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Cnga4Q3UW12 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,62
Cnga4Q3UW12 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Cnga4Q3UW12 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,08■■■□□ 2,57
Cnga4Q3UW12 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,56
Cnga4Q3UW12 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Cnga4Q3UW12 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,96■■■□□ 2,55
Cnga4Q3UW12 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Cnga4Q3UW12 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Cnga4Q3UW12 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Cnga4Q3UW12 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Cnga4Q3UW12 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,55■■■□□ 2,48
Cnga4Q3UW12 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,48
Cnga4Q3UW12 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,44■■■□□ 2,46
Cnga4Q3UW12 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Cnga4Q3UW12 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Cnga4Q3UW12 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Cnga4Q3UW12 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Cnga4Q3UW12 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,08■■■□□ 2,41
Cnga4Q3UW12 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Cnga4Q3UW12 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Cnga4Q3UW12 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Cnga4Q3UW12 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Cnga4Q3UW12 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Cnga4Q3UW12 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,76■■■□□ 2,36
Cnga4Q3UW12 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Cnga4Q3UW12 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Cnga4Q3UW12 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Cnga4Q3UW12 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Cnga4Q3UW12 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Cnga4Q3UW12 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Cnga4Q3UW12 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Cnga4Q3UW12 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,54■■■□□ 2,32
Cnga4Q3UW12 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Cnga4Q3UW12 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Cnga4Q3UW12 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Cnga4Q3UW12 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Cnga4Q3UW12 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Cnga4Q3UW12 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Cnga4Q3UW12 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Cnga4Q3UW12 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Cnga4Q3UW12 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,14■■■□□ 2,26
Cnga4Q3UW12 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Cnga4Q3UW12 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Cnga4Q3UW12 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Cnga4Q3UW12 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Cnga4Q3UW12 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Cnga4Q3UW12 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,82■■■□□ 2,2
Cnga4Q3UW12 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Cnga4Q3UW12 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Cnga4Q3UW12 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Cnga4Q3UW12 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Cnga4Q3UW12 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Cnga4Q3UW12 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Cnga4Q3UW12 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,71■■■□□ 2,19
Cnga4Q3UW12 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Cnga4Q3UW12 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Cnga4Q3UW12 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Cnga4Q3UW12 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Cnga4Q3UW12 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Cnga4Q3UW12 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Cnga4Q3UW12 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Cnga4Q3UW12 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,43■■■□□ 2,14
Cnga4Q3UW12 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Cnga4Q3UW12 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Cnga4Q3UW12 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Cnga4Q3UW12 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Cnga4Q3UW12 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Cnga4Q3UW12 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Cnga4Q3UW12 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Cnga4Q3UW12 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Cnga4Q3UW12 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Cnga4Q3UW12 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Cnga4Q3UW12 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Cnga4Q3UW12 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Cnga4Q3UW12 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Cnga4Q3UW12 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Cnga4Q3UW12 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Cnga4Q3UW12 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Cnga4Q3UW12 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Cnga4Q3UW12 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Cnga4Q3UW12 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Cnga4Q3UW12 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Cnga4Q3UW12 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Cnga4Q3UW12 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Cnga4Q3UW12 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Cnga4Q3UW12 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Cnga4Q3UW12 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Cnga4Q3UW12 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59,7 ms