Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45.32■■■■■ 4.85
Sox10Q04888 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Sox10Q04888 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Sox10Q04888 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
Sox10Q04888 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
Sox10Q04888 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Sox10Q04888 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Sox10Q04888 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Sox10Q04888 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Sox10Q04888 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Sox10Q04888 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Sox10Q04888 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Sox10Q04888 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Sox10Q04888 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Sox10Q04888 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Sox10Q04888 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Sox10Q04888 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Sox10Q04888 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Sox10Q04888 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Sox10Q04888 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Sox10Q04888 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Sox10Q04888 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
Sox10Q04888 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Sox10Q04888 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Sox10Q04888 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Sox10Q04888 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Sox10Q04888 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Sox10Q04888 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Sox10Q04888 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Sox10Q04888 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Sox10Q04888 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Sox10Q04888 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Sox10Q04888 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Sox10Q04888 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Sox10Q04888 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Sox10Q04888 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Sox10Q04888 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Sox10Q04888 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Sox10Q04888 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Sox10Q04888 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Sox10Q04888 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Sox10Q04888 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Sox10Q04888 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Sox10Q04888 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Sox10Q04888 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Sox10Q04888 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Sox10Q04888 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Sox10Q04888 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Sox10Q04888 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Sox10Q04888 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Sox10Q04888 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Sox10Q04888 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Sox10Q04888 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Sox10Q04888 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Sox10Q04888 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Sox10Q04888 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Sox10Q04888 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Sox10Q04888 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Sox10Q04888 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Sox10Q04888 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Sox10Q04888 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Sox10Q04888 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Sox10Q04888 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Sox10Q04888 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Sox10Q04888 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Sox10Q04888 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Sox10Q04888 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Sox10Q04888 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Sox10Q04888 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Sox10Q04888 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Sox10Q04888 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Sox10Q04888 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Sox10Q04888 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Sox10Q04888 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Sox10Q04888 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Sox10Q04888 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Sox10Q04888 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Sox10Q04888 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Sox10Q04888 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Sox10Q04888 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Sox10Q04888 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Sox10Q04888 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Sox10Q04888 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Sox10Q04888 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Sox10Q04888 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Sox10Q04888 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Sox10Q04888 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Sox10Q04888 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Sox10Q04888 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Sox10Q04888 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Sox10Q04888 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Sox10Q04888 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Sox10Q04888 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Sox10Q04888 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Sox10Q04888 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Sox10Q04888 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sox10Q04888 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sox10Q04888 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Sox10Q04888 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sox10Q04888 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms