Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45,32■■■■■ 4,85
Sox10Q04888 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42,44■■■■■ 4,38
Sox10Q04888 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,67■■■■■ 4,26
Sox10Q04888 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39,91■■■■□ 3,98
Sox10Q04888 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38,56■■■■□ 3,76
Sox10Q04888 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38,46■■■■□ 3,75
Sox10Q04888 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,3■■■■□ 3,72
Sox10Q04888 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,18■■■■□ 3,7
Sox10Q04888 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,85■■■■□ 3,65
Sox10Q04888 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37,69■■■■□ 3,62
Sox10Q04888 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37,56■■■■□ 3,6
Sox10Q04888 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37,49■■■■□ 3,59
Sox10Q04888 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,4■■■■□ 3,58
Sox10Q04888 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,34■■■■□ 3,57
Sox10Q04888 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,27■■■■□ 3,56
Sox10Q04888 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,25■■■■□ 3,55
Sox10Q04888 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37,02■■■■□ 3,52
Sox10Q04888 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
Sox10Q04888 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Sox10Q04888 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36,2■■■■□ 3,39
Sox10Q04888 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,13■■■■□ 3,37
Sox10Q04888 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36,1■■■■□ 3,37
Sox10Q04888 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Sox10Q04888 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Sox10Q04888 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35,78■■■■□ 3,32
Sox10Q04888 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Sox10Q04888 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Sox10Q04888 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,27■■■■□ 3,24
Sox10Q04888 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,14■■■■□ 3,22
Sox10Q04888 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35,13■■■■□ 3,21
Sox10Q04888 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35,11■■■■□ 3,21
Sox10Q04888 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35,1■■■■□ 3,21
Sox10Q04888 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,19
Sox10Q04888 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Sox10Q04888 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34,71■■■■□ 3,15
Sox10Q04888 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34,69■■■■□ 3,14
Sox10Q04888 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34,69■■■■□ 3,14
Sox10Q04888 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
Sox10Q04888 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34,62■■■■□ 3,13
Sox10Q04888 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Sox10Q04888 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Sox10Q04888 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34,48■■■■□ 3,11
Sox10Q04888 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Sox10Q04888 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Sox10Q04888 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,45■■■■□ 3,11
Sox10Q04888 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,42■■■■□ 3,1
Sox10Q04888 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34,41■■■■□ 3,1
Sox10Q04888 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Sox10Q04888 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34,32■■■■□ 3,08
Sox10Q04888 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34,2■■■■□ 3,07
Sox10Q04888 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Sox10Q04888 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Sox10Q04888 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Sox10Q04888 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Sox10Q04888 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33,73■■■□□ 2,99
Sox10Q04888 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33,73■■■□□ 2,99
Sox10Q04888 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,68■■■□□ 2,98
Sox10Q04888 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33,66■■■□□ 2,98
Sox10Q04888 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Sox10Q04888 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33,54■■■□□ 2,96
Sox10Q04888 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Sox10Q04888 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Sox10Q04888 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Sox10Q04888 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Sox10Q04888 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33,29■■■□□ 2,92
Sox10Q04888 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33,27■■■□□ 2,92
Sox10Q04888 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Sox10Q04888 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Sox10Q04888 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Sox10Q04888 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33,11■■■□□ 2,89
Sox10Q04888 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33,1■■■□□ 2,89
Sox10Q04888 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Sox10Q04888 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Sox10Q04888 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,99■■■□□ 2,87
Sox10Q04888 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Sox10Q04888 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,95■■■□□ 2,86
Sox10Q04888 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Sox10Q04888 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Sox10Q04888 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Sox10Q04888 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32,76■■■□□ 2,83
Sox10Q04888 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32,76■■■□□ 2,83
Sox10Q04888 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Sox10Q04888 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32,72■■■□□ 2,83
Sox10Q04888 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32,72■■■□□ 2,83
Sox10Q04888 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32,63■■■□□ 2,81
Sox10Q04888 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Sox10Q04888 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Sox10Q04888 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32,56■■■□□ 2,8
Sox10Q04888 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Sox10Q04888 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Sox10Q04888 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Sox10Q04888 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Sox10Q04888 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Sox10Q04888 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32,48■■■□□ 2,79
Sox10Q04888 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Sox10Q04888 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Sox10Q04888 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,46■■■□□ 2,79
Sox10Q04888 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,43■■■□□ 2,78
Sox10Q04888 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Sox10Q04888 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46,1 ms