Protein–RNA interactions for Protein: Q4VK74

Ifnl2, Interferon lambda-2, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnl2Q4VK74 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Ifnl2Q4VK74 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ifnl2Q4VK74 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ifnl2Q4VK74 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Ifnl2Q4VK74 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ifnl2Q4VK74 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Ifnl2Q4VK74 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ifnl2Q4VK74 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ifnl2Q4VK74 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Ifnl2Q4VK74 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ifnl2Q4VK74 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ifnl2Q4VK74 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ifnl2Q4VK74 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Ifnl2Q4VK74 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
Ifnl2Q4VK74 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ifnl2Q4VK74 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ifnl2Q4VK74 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ifnl2Q4VK74 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ifnl2Q4VK74 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ifnl2Q4VK74 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ifnl2Q4VK74 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Ifnl2Q4VK74 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ifnl2Q4VK74 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ifnl2Q4VK74 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ifnl2Q4VK74 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ifnl2Q4VK74 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ifnl2Q4VK74 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ifnl2Q4VK74 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Ifnl2Q4VK74 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ifnl2Q4VK74 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ifnl2Q4VK74 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ifnl2Q4VK74 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ifnl2Q4VK74 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ifnl2Q4VK74 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ifnl2Q4VK74 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ifnl2Q4VK74 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Ifnl2Q4VK74 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ifnl2Q4VK74 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ifnl2Q4VK74 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ifnl2Q4VK74 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ifnl2Q4VK74 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ifnl2Q4VK74 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ifnl2Q4VK74 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ifnl2Q4VK74 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ifnl2Q4VK74 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Ifnl2Q4VK74 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ifnl2Q4VK74 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ifnl2Q4VK74 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ifnl2Q4VK74 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Ifnl2Q4VK74 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ifnl2Q4VK74 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ifnl2Q4VK74 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ifnl2Q4VK74 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ifnl2Q4VK74 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ifnl2Q4VK74 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ifnl2Q4VK74 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Ifnl2Q4VK74 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ifnl2Q4VK74 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ifnl2Q4VK74 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ifnl2Q4VK74 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ifnl2Q4VK74 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Ifnl2Q4VK74 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ifnl2Q4VK74 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ifnl2Q4VK74 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ifnl2Q4VK74 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ifnl2Q4VK74 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ifnl2Q4VK74 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ifnl2Q4VK74 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ifnl2Q4VK74 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ifnl2Q4VK74 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ifnl2Q4VK74 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ifnl2Q4VK74 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ifnl2Q4VK74 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ifnl2Q4VK74 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ifnl2Q4VK74 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ifnl2Q4VK74 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ifnl2Q4VK74 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ifnl2Q4VK74 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ifnl2Q4VK74 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ifnl2Q4VK74 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ifnl2Q4VK74 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ifnl2Q4VK74 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ifnl2Q4VK74 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ifnl2Q4VK74 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ifnl2Q4VK74 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ifnl2Q4VK74 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ifnl2Q4VK74 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ifnl2Q4VK74 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ifnl2Q4VK74 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ifnl2Q4VK74 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ifnl2Q4VK74 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ifnl2Q4VK74 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ifnl2Q4VK74 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ifnl2Q4VK74 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ifnl2Q4VK74 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ifnl2Q4VK74 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ifnl2Q4VK74 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ifnl2Q4VK74 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ifnl2Q4VK74 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ifnl2Q4VK74 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms