Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
CkbQ04447 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CkbQ04447 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CkbQ04447 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
CkbQ04447 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
CkbQ04447 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CkbQ04447 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CkbQ04447 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CkbQ04447 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CkbQ04447 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CkbQ04447 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CkbQ04447 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CkbQ04447 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CkbQ04447 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CkbQ04447 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CkbQ04447 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CkbQ04447 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CkbQ04447 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CkbQ04447 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CkbQ04447 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CkbQ04447 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CkbQ04447 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CkbQ04447 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CkbQ04447 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CkbQ04447 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CkbQ04447 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CkbQ04447 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CkbQ04447 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CkbQ04447 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CkbQ04447 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CkbQ04447 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CkbQ04447 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CkbQ04447 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CkbQ04447 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CkbQ04447 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CkbQ04447 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
CkbQ04447 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CkbQ04447 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CkbQ04447 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CkbQ04447 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CkbQ04447 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CkbQ04447 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CkbQ04447 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CkbQ04447 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CkbQ04447 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CkbQ04447 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CkbQ04447 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
CkbQ04447 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CkbQ04447 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CkbQ04447 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CkbQ04447 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CkbQ04447 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CkbQ04447 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CkbQ04447 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CkbQ04447 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CkbQ04447 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CkbQ04447 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CkbQ04447 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CkbQ04447 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CkbQ04447 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CkbQ04447 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CkbQ04447 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CkbQ04447 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CkbQ04447 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CkbQ04447 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CkbQ04447 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CkbQ04447 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CkbQ04447 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CkbQ04447 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CkbQ04447 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CkbQ04447 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CkbQ04447 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CkbQ04447 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CkbQ04447 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CkbQ04447 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CkbQ04447 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CkbQ04447 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CkbQ04447 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CkbQ04447 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CkbQ04447 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CkbQ04447 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CkbQ04447 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CkbQ04447 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CkbQ04447 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CkbQ04447 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CkbQ04447 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CkbQ04447 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CkbQ04447 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CkbQ04447 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CkbQ04447 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CkbQ04447 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CkbQ04447 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CkbQ04447 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CkbQ04447 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CkbQ04447 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CkbQ04447 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CkbQ04447 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CkbQ04447 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CkbQ04447 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CkbQ04447 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms