Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40,7■■■■■ 4,11
CkbQ04447 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37,72■■■■□ 3,63
CkbQ04447 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
CkbQ04447 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35,51■■■■□ 3,28
CkbQ04447 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35,34■■■■□ 3,25
CkbQ04447 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34,67■■■■□ 3,14
CkbQ04447 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
CkbQ04447 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
CkbQ04447 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
CkbQ04447 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
CkbQ04447 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
CkbQ04447 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,98■■■■□ 3,03
CkbQ04447 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
CkbQ04447 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,55■■■□□ 2,96
CkbQ04447 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
CkbQ04447 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,03■■■□□ 2,88
CkbQ04447 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
CkbQ04447 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32,77■■■□□ 2,84
CkbQ04447 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32,77■■■□□ 2,84
CkbQ04447 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,73■■■□□ 2,83
CkbQ04447 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
CkbQ04447 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,69■■■□□ 2,82
CkbQ04447 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
CkbQ04447 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
CkbQ04447 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
CkbQ04447 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
CkbQ04447 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
CkbQ04447 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
CkbQ04447 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
CkbQ04447 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
CkbQ04447 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32,19■■■□□ 2,74
CkbQ04447 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32,18■■■□□ 2,74
CkbQ04447 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
CkbQ04447 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,04■■■□□ 2,72
CkbQ04447 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
CkbQ04447 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,82■■■□□ 2,68
CkbQ04447 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
CkbQ04447 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,56■■■□□ 2,64
CkbQ04447 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,46■■■□□ 2,63
CkbQ04447 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
CkbQ04447 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
CkbQ04447 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31,29■■■□□ 2,6
CkbQ04447 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,22■■■□□ 2,59
CkbQ04447 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31,17■■■□□ 2,58
CkbQ04447 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
CkbQ04447 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
CkbQ04447 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,08■■■□□ 2,57
CkbQ04447 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
CkbQ04447 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
CkbQ04447 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,94■■■□□ 2,54
CkbQ04447 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30,92■■■□□ 2,54
CkbQ04447 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,9■■■□□ 2,54
CkbQ04447 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,64■■■□□ 2,5
CkbQ04447 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
CkbQ04447 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
CkbQ04447 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,63■■■□□ 2,49
CkbQ04447 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
CkbQ04447 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
CkbQ04447 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30,56■■■□□ 2,48
CkbQ04447 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
CkbQ04447 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30,48■■■□□ 2,47
CkbQ04447 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,46■■■□□ 2,47
CkbQ04447 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30,35■■■□□ 2,45
CkbQ04447 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
CkbQ04447 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
CkbQ04447 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,3■■■□□ 2,44
CkbQ04447 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
CkbQ04447 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,29■■■□□ 2,44
CkbQ04447 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30,21■■■□□ 2,43
CkbQ04447 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
CkbQ04447 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30,17■■■□□ 2,42
CkbQ04447 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,16■■■□□ 2,42
CkbQ04447 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
CkbQ04447 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30,13■■■□□ 2,41
CkbQ04447 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,12■■■□□ 2,41
CkbQ04447 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
CkbQ04447 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
CkbQ04447 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
CkbQ04447 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
CkbQ04447 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
CkbQ04447 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
CkbQ04447 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
CkbQ04447 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30,02■■■□□ 2,4
CkbQ04447 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
CkbQ04447 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,96■■■□□ 2,39
CkbQ04447 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
CkbQ04447 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,94■■■□□ 2,38
CkbQ04447 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
CkbQ04447 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
CkbQ04447 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29,83■■■□□ 2,37
CkbQ04447 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
CkbQ04447 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
CkbQ04447 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
CkbQ04447 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
CkbQ04447 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
CkbQ04447 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,72■■■□□ 2,35
CkbQ04447 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,68■■■□□ 2,34
CkbQ04447 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,64■■■□□ 2,34
CkbQ04447 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
CkbQ04447 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms