Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
Capn9Q9D805 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Capn9Q9D805 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Capn9Q9D805 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Capn9Q9D805 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Capn9Q9D805 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Capn9Q9D805 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Capn9Q9D805 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Capn9Q9D805 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Capn9Q9D805 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Capn9Q9D805 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Capn9Q9D805 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Capn9Q9D805 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Capn9Q9D805 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Capn9Q9D805 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Capn9Q9D805 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Capn9Q9D805 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Capn9Q9D805 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Capn9Q9D805 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Capn9Q9D805 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Capn9Q9D805 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Capn9Q9D805 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Capn9Q9D805 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Capn9Q9D805 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Capn9Q9D805 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Capn9Q9D805 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Capn9Q9D805 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Capn9Q9D805 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Capn9Q9D805 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Capn9Q9D805 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Capn9Q9D805 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Capn9Q9D805 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Capn9Q9D805 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Capn9Q9D805 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Capn9Q9D805 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Capn9Q9D805 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Capn9Q9D805 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Capn9Q9D805 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Capn9Q9D805 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Capn9Q9D805 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Capn9Q9D805 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Capn9Q9D805 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Capn9Q9D805 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Capn9Q9D805 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Capn9Q9D805 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Capn9Q9D805 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Capn9Q9D805 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Capn9Q9D805 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Capn9Q9D805 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Capn9Q9D805 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Capn9Q9D805 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Capn9Q9D805 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Capn9Q9D805 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Capn9Q9D805 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Capn9Q9D805 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Capn9Q9D805 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Capn9Q9D805 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Capn9Q9D805 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Capn9Q9D805 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Capn9Q9D805 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Capn9Q9D805 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Capn9Q9D805 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Capn9Q9D805 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Capn9Q9D805 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Capn9Q9D805 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Capn9Q9D805 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Capn9Q9D805 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Capn9Q9D805 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Capn9Q9D805 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Capn9Q9D805 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Capn9Q9D805 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Capn9Q9D805 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Capn9Q9D805 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Capn9Q9D805 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Capn9Q9D805 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Capn9Q9D805 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Capn9Q9D805 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Capn9Q9D805 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Capn9Q9D805 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Capn9Q9D805 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Capn9Q9D805 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Capn9Q9D805 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Capn9Q9D805 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Capn9Q9D805 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Capn9Q9D805 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Capn9Q9D805 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Capn9Q9D805 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Capn9Q9D805 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Capn9Q9D805 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Capn9Q9D805 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Capn9Q9D805 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Capn9Q9D805 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Capn9Q9D805 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Capn9Q9D805 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Capn9Q9D805 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Capn9Q9D805 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Capn9Q9D805 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Capn9Q9D805 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Capn9Q9D805 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Capn9Q9D805 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms