RNA–Protein interactions for RNA: YML023C

NSE5, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeast

Gene NSE5, Length 1,671 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSE5	YML023C	ATP15	P21306	62 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	YER188W	P40103	239 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	FMP27	Q06179	2628 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	UBC5	P15732	148 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	MRS4	P23500	304 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	OMA1	P36163	345 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	SDH4	P37298	181 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	FLO5	P38894	1075 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	TEM1	P38987	245 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	YAR029W	P39549	74 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	WSC2	P53832	503 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	COX4	P04037	155 aa		5	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	ERV15	P38312	142 aa		5	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	5	□□□□□ -1.61	not detected
NSE5	YML023C	MPM1	P40364	252 aa		5	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	PHS1	P40857	217 aa		5	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	SYS1	P41544	203 aa		5	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	NSE4	P43124	402 aa		5	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	EMC4	P53073	190 aa		5	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	LAA1	P39526	2014 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	VMA11	P32842	164 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	UPS1	Q05776	175 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	SLD7	Q08457	257 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	YER134C	P40081	178 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	YMR244W	Q04018	355 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	JID1	Q12350	301 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	YPL247C	Q12523	523 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	SFT2	P38166	215 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	GAT4	P40569	121 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	YNR062C	P53748	327 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	YMR252C	Q04814	134 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	CRC1	Q12289	327 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	YAR068W	P39564	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	YDR102C	Q03864	110 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	ANT1	Q06497	328 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.96	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.96	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.96	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	YHR130C	P38834	111 aa		4.96	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	YFL067W	P43537	175 aa		4.96	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	NDD1	Q08887	554 aa		4.96	□□□□□ -1.61
NSE5	YML023C	YAR023C	D6VPM8	179 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	PAM16	P42949	149 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	PST1	Q12355	444 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	CUP9	P41817	306 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	YMR103C	Q04436	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	GAL83	Q04739	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	FYV12	Q08559	129 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	RNQ1	P25367	405 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	MOH1	P38191	138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	SPC25	P40014	221 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	TVP15	Q03860	143 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	API2	Q04413	109 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	SYM1	Q06563	197 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	IRA2	P19158	3079 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	COX10	P21592	462 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	YEL028W	P39989	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	RCE1	Q03530	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	YCR050C	P25630	102 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	ECM31	P38122	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	YER135C	P40082	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	SAY1	P53324	424 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	YDR115W	Q04598	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	KEI1	Q06346	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	ODC2	Q99297	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	YGL118C	P53132	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	SGA1	P08019	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	SDH3	P33421	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	YIL059C	P40520	121 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSE5	YML023C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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