RNA–Protein interactions for RNA: YGR252W

GCN5, Transcript of Catalytic subunit of ADA and SAGA histone acetyltransferase complexes, yeast

Gene GCN5, Length 1,320 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GCN5	YGR252W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	UPS3	Q04006	179 aa		3.14	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	GRE1	Q08969	168 aa		3.14	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	3.14	□□□□□ -1.91	not detected
GCN5	YGR252W	YDL009C	Q12210	107 aa		3.14	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		3.14	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	VPS63	O13549	108 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	DDI2	P0CH63	225 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	DDI3	P0CH64	225 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	CUP2	P15315	225 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	MIG1	P27705	504 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	PAM17	P36147	197 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	PFS1	P38872	237 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	SRP14	P38985	146 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	YER188W	P40103	239 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	YIL086C	P40503	102 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	REE1	P40893	198 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	CIS3	P47001	227 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	YJL028W	P47062	111 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	TDA4	P47153	279 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	DSK2	P48510	373 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	UPS1	Q05776	175 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	FIT3	Q08907	204 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	YPS3	Q12303	508 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	SAG1	P20840	650 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	IMP1	P28627	190 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	QRI5	P32344	111 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	MCH2	P36032	473 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	SRX1	P36077	127 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	BDH1	P39714	382 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	YJL213W	P40896	331 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	SAS2	P40963	338 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	YJR015W	P47090	510 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	YDL186W	P48568	277 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	YGR017W	P53210	297 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	CPD1	P53314	239 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	LPP1	Q04396	274 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	YPR098C	Q06089	161 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	ATG39	Q06159	398 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	YOL118C	Q08259	102 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	CSM4	Q08955	156 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	GEP5	Q12393	293 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	BOL1	Q3E793	110 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	PAI3	P01094	68 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	SEC11	P15367	167 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	YMR31	P19955	123 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	ROX3	P25046	220 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	ZRT1	P32804	376 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	YER121W	P40076	114 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	UBC13	P52490	153 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	PCP1	P53259	346 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	WSC2	P53832	503 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	ATP19	P81451	68 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	DYN2	Q02647	92 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	SLO1	Q3E784	85 aa		3.11	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	FPR2	P32472	135 aa		3.1	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	YHL044W	P38727	235 aa		3.1	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	YHR173C	P38864	112 aa		3.1	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	CAB4	P53332	305 aa		3.1	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	SDC1	Q03323	175 aa		3.1	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	LIP2	Q06005	328 aa		3.1	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	YDL180W	Q12301	547 aa		3.1	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	SCS22	Q6Q595	175 aa		3.1	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		3.1	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		3.1	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	MRS1	P07266	363 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	RPL12B	P0CX54	165 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	TIR1	P10863	254 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	YKL097C	P34245	136 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GCN5	YGR252W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91

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