RNA–Protein interactions for RNA: YMR082C

YMR082C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YMR082C, Length 357 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR082C	YMR082C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YMR082C	YMR082C	ECM34	P38728	170 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YMR082C	YMR082C	FIP1	P45976	327 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YMR082C	YMR082C	DSK2	P48510	373 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YMR082C	YMR082C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YMR082C	YMR082C	ATG39	Q06159	398 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YMR082C	YMR082C	MCP1	Q12106	302 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YMR082C	YMR082C	YCR043C	P25361	127 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	HYM1	P32464	399 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	CSH1	P38287	376 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	MIG3	P39943	394 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	CAX4	P53223	239 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	YGR219W	P53307	113 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	APJ1	P53940	528 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	OSH6	Q02201	448 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	GRX5	Q02784	150 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	YOL029C	Q08187	201 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	YIL177C	P40434	1758 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	YJL225C	P40889	1758 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	HAP1	P0CE41	1502 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	REP2	P03872	296 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	DDI2	P0CH63	225 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	DDI3	P0CH64	225 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	ANB1	P19211	157 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	PHO13	P19881	312 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	YHL026C	P38740	315 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	3.64	□□□□□ -1.83	not detected
YMR082C	YMR082C	PGU1	P47180	361 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	MRPS8	Q03799	155 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	YOL014W	Q08110	124 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	SRL1	Q08673	210 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	ODC2	Q99297	307 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	RRT13	P40042	185 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	YFL019C	P43576	117 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	YGL193C	P53097	103 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	ECM19	Q06011	112 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	MCH1	Q07376	486 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	CAT8	P39113	1433 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	YBT1	P32386	1661 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	PAC10	P48363	199 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	NAT3	Q06504	195 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	RTR2	Q12378	196 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	IML1	P47170	1584 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	YAR023C	D6VPM8	179 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	RAD6	P06104	172 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	SGA1	P08019	549 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	SPS2	P08459	502 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	ATP15	P21306	62 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	AHT1	P29589	182 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	ETR1	P38071	380 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	YGR026W	P53217	278 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	UMP1	P38293	148 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	YHR140W	P38842	239 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	SFT1	P43682	97 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	SPG1	P50088	95 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	EMC4	P53073	190 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	YKR005C	Q02203	525 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	TIM9	O74700	87 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	SPT14	P32363	452 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	YOR062C	P36025	268 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	YHR125W	P38831	101 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	YER188W	P40103	239 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	ELC1	Q03071	99 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	YMR295C	Q03559	197 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	SCW10	Q04951	389 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	RRT7	Q07829	113 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YMR082C	YMR082C	COX4	P04037	155 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR082C	YMR082C	GPA2	P10823	449 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR082C	YMR082C	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YMR082C	YMR082C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YMR082C	YMR082C	RPB11	P38902	120 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR082C	YMR082C	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	3.58	□□□□□ -1.84	not detected
YMR082C	YMR082C	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YMR082C	YMR082C	GEP7	P53171	287 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR082C	YMR082C	SYM1	Q06563	197 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR082C	YMR082C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR082C	YMR082C	VMR1	P38735	1592 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR082C	YMR082C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
YMR082C	YMR082C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
YMR082C	YMR082C	MOB1	P40484	314 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR082C	YMR082C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
YMR082C	YMR082C	BUD25	P85052	153 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR082C	YMR082C	EST3	Q03096	181 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR082C	YMR082C	HAP2	P06774	265 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR082C	YMR082C	RPB9	P27999	122 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR082C	YMR082C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.56	□□□□□ -1.84	not detected
YMR082C	YMR082C	YBR242W	P38331	238 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR082C	YMR082C	CUP9	P41817	306 aa		3.56	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 28.2 ms