RNA–Protein interactions for RNA: YLR117C

CLF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene CLF1, Length 2,064 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLF1	YLR117C	YLR415C	O13578	112 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLF1	YLR117C	HEM4	P06174	275 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLF1	YLR117C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CLF1	YLR117C	PDE1	P22434	369 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLF1	YLR117C	SRP21	P32342	167 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLF1	YLR117C	YBR090C	P38253	122 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLF1	YLR117C	UBS1	P38290	277 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLF1	YLR117C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CLF1	YLR117C	TIM17	P39515	158 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLF1	YLR117C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CLF1	YLR117C	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CLF1	YLR117C	TGL2	P54857	326 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLF1	YLR117C	ERF2	Q06551	359 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLF1	YLR117C	POM34	Q12445	299 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CLF1	YLR117C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CLF1	YLR117C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	KRE1	P17260	313 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	ERG28	P40030	148 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	ATF1	P40353	525 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YDL186W	P48568	277 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	CDH1	P53197	566 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YNR048W	P53740	393 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	PIR3	Q03180	325 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	MSI1	P13712	422 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	CPT1	P17898	393 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	ERG2	P32352	222 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	DSS4	P32601	143 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YHL026C	P38740	315 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	SNF11	P38956	169 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	DFG10	P40526	253 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	CTK2	P46962	323 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YIP5	P53108	310 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YNR040W	P53736	256 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YPL039W	Q03080	316 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	SUT2	Q12286	268 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	RAD6	P06104	172 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	QCR9	P22289	66 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	RPB7	P34087	171 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	IML3	P38265	245 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	RPP1	P38786	293 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	PCL5	P38794	229 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	TDA4	P47153	279 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YIP1	P53039	248 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YGR039W	P53225	103 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YOR376W	Q08900	122 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	CTA1	P15202	515 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	TIM12	P32830	109 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	CYB5	P40312	120 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YIL059C	P40520	121 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	BRP1	P53194	125 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	AIM34	Q03673	198 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YPL264C	Q08980	353 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	CPR2	P23285	205 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	ERV1	P27882	189 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YBL059W	P34224	193 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	OM14	P38325	134 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	GGC1	P38988	300 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YGR269W	P40326	108 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	SAS2	P40963	338 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	EGT2	P42835	1041 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	CWP2	P43497	92 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	PRY1	P47032	299 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	BRR6	P53062	197 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	CPD1	P53314	239 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YDL218W	Q07629	317 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YLR012C	Q07927	99 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	OPI10	Q08202	246 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YPQ1	Q12010	308 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	AYT1	Q12226	474 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YPR064W	Q12492	139 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	VMA11	P32842	164 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YPT10	P38146	199 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	TVP23	P38962	199 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YIL163C	P40448	117 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	APQ12	P40532	138 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	FLO9	P39712	1322 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	UBC5	P15732	148 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	VMA3	P25515	160 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	QRI5	P32344	111 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	SUN4	P53616	420 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	MIX17	Q03667	156 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YMR007W	Q03675	126 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	GEP3	Q08622	556 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CLF1	YLR117C	YJL193W	P39542	402 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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