RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	PAU5	P43575	122 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	ATG27	P46989	271 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	LST7	P53237	242 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	APS2	Q00381	147 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	YHP1	Q04116	353 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	NAT3	Q06504	195 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	ARR2	Q06597	130 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	YOP1	Q12402	180 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	PAU19	P0CE85	124 aa		5.36	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	PAU21	P0CE86	164 aa		5.36	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	PAU22	P0CE87	164 aa		5.36	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	SPS100	P13130	326 aa		5.36	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	PAU3	P25610	124 aa		5.36	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	FPR2	P32472	135 aa		5.36	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	IES6	P32617	166 aa		5.36	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	SSS1	P35179	80 aa		5.36	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	PMU1	P36069	295 aa		5.36	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	SUR2	P38992	349 aa		5.36	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	IRC22	P40006	225 aa		5.36	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	GET2	P40056	285 aa		5.36	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	CYB5	P40312	120 aa		5.36	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	SAS2	P40963	338 aa		5.36	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	DSK2	P48510	373 aa		5.36	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	YIP1	P53039	248 aa		5.36	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	NDE2	Q07500	545 aa		5.36	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	DCN1	Q12395	269 aa		5.36	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	YGL010W	P25338	174 aa		5.35	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	YKL187C	P34231	750 aa		5.35	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	GPI2	P46961	280 aa		5.35	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	LAS17	Q12446	633 aa		5.35	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	PHD1	P36093	366 aa		5.34	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	DAD2	P36162	133 aa		5.34	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	MRPL28	P36527	147 aa		5.34	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	YBL071C	P38185	102 aa		5.34	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	GPI18	P38211	433 aa		5.34	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	YHL044W	P38727	235 aa		5.34	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	YAR068W	P39564	161 aa		5.34	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	YIL163C	P40448	117 aa		5.34	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	LST8	P41318	303 aa		5.34	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	SBH2	P52871	88 aa		5.34	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	TIM10	P87108	93 aa		5.34	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	STD1	Q02794	444 aa		5.34	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	MCH1	Q07376	486 aa		5.34	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	5.33	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	YKL075C	P36083	450 aa		5.33	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	5.33	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	SNA4	Q07549	140 aa		5.33	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	JID1	Q12350	301 aa		5.33	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	GEP5	Q12393	293 aa		5.33	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	AVT5	P38176	459 aa		5.32	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	CSH1	P38287	376 aa		5.32	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	YGL185C	P53100	379 aa		5.32	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	YGR151C	P53287	111 aa		5.32	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	YNR071C	P53757	342 aa		5.32	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	MIX17	Q03667	156 aa		5.32	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	SDH7	Q04401	133 aa		5.32	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	STP4	Q07351	490 aa		5.32	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		5.31	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	DOG2	P38773	246 aa		5.31	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	DOG1	P38774	246 aa		5.31	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	BDH1	P39714	382 aa		5.31	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	GAT2	P40209	560 aa		5.31	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	5.31	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	YOR105W	Q08504	108 aa		5.31	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	YPR063C	Q12160	140 aa		5.31	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	YLR302C	O13544	120 aa		5.3	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	PHO85	P17157	305 aa		5.3	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	YCR022C	P25620	114 aa		5.3	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	YHR173C	P38864	112 aa		5.3	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	CYT2	Q00873	224 aa		5.3	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	CSI2	Q08054	341 aa		5.3	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	ATO3	Q12359	275 aa		5.3	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		5.3	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	SRP21	P32342	167 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	YKR045C	P36138	183 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	SFT2	P38166	215 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	RRT1	P38192	103 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	ICS2	P38284	255 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	RPB11	P38902	120 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	NCA3	P46955	337 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	YGR149W	P48236	432 aa		5.29	□□□□□ -1.56

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