RNA–Protein interactions for RNA: YKL125W

RRN3, Transcript of Protein required for transcription of rDNA by RNA polymerase I, yeastyeast

Gene RRN3, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN3YKL125W YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa4.54□□□□□ -1.68
RRN3YKL125W FMP49A0A023PZB3 126 aa4.54□□□□□ -1.68
RRN3YKL125W YPR096CO13587 100 aa4.54□□□□□ -1.68
RRN3YKL125W YCR025CP25352 136 aa4.54□□□□□ -1.68
RRN3YKL125W AGA2P32781 87 aa4.54□□□□□ -1.68
RRN3YKL125W RPS20P38701 121 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RRN3YKL125W TOS2P50078 622 aa4.54□□□□□ -1.68
RRN3YKL125W YPR098CQ06089 161 aa4.54□□□□□ -1.68
RRN3YKL125W MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RRN3YKL125W CRD1Q07560 283 aa4.54□□□□□ -1.68
RRN3YKL125W YDL218WQ07629 317 aa4.54□□□□□ -1.68
RRN3YKL125W YOR029WQ12243 111 aa4.54□□□□□ -1.68
RRN3YKL125W OPI3P05375 206 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3YKL125W MTC7P32633 139 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3YKL125W VMA11P32842 164 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3YKL125W YGP1P38616 354 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RRN3YKL125W YNL194CP40169 301 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3YKL125W SUN4P53616 420 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3YKL125W YDL242WQ07746 117 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3YKL125W PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RRN3YKL125W TAD3Q9URQ3 322 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3YKL125W RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W BET2P20133 325 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W CPR2P23285 205 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W INO2P26798 304 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W RPB7P34087 171 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W PHO88P38264 188 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W ELO1P39540 310 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W EGT2P42835 1041 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W SCW4P53334 386 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W YHM2Q04013 314 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W RIM9Q04734 239 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W PHO85P17157 305 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W RNQ1P25367 405 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W YCR100CP25606 316 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W MAC1P35192 417 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W SHB17P36136 271 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W BTT1P40314 149 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W APQ12P40532 138 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W YFR020WP43600 232 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W LCB3P47013 409 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W ABF2Q02486 183 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W YML079WQ03629 201 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W DAP1Q12091 152 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W SWT1Q12104 458 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W YLR149CQ99296 730 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W UBA3Q99344 299 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W RPS13P05756 151 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W YOL162WP0CF19 215 aa4.51□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W RFA3P26755 122 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W YJL193WP39542 402 aa4.51□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W CCS1P40202 249 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W ARP3P47117 449 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W OGG1P53397 376 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W YMR320WQ04897 101 aa4.51□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W YLR296WQ05898 108 aa4.51□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W YDR119W-AQ2V2P9 66 aa4.51□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W YKL183C-AQ3E765 70 aa4.51□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W COA2Q3E823 68 aa4.51□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W YDR157WA0A023PZE8 133 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W AHT1P29589 182 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W PAM17P36147 197 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W SNF11P38956 169 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W YAR068WP39564 161 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W XBP1P40489 647 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data4.5□□□□□ -1.69not detected
RRN3YKL125W BAT2P47176 376 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W CSL4P53859 292 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W SWT21P53873 357 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W AQR1P53943 586 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W VPS71Q03433 280 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W MSB2P32334 1306 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W SPO13P23624 291 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W AUR1P36107 401 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W VID24P38263 362 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W MIC27P50945 234 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W SBH1P52870 82 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W RHO5P53879 331 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W RAV2Q03956 351 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W LPP1Q04396 274 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W FCY1Q12178 158 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W MDH2P22133 377 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W YCR085WP25650 117 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W FUN19P28003 413 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W MID2P36027 376 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W CUP9P41817 306 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W CDH1P53197 566 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W PIR3Q03180 325 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W FIT3Q08907 204 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W YPL264CQ08980 353 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W RAD6P06104 172 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W HEM4P06174 275 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W CDC21P06785 304 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W YSR3P23501 404 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W YNL195CP40168 261 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN3YKL125W BXI1P48558 297 aa4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 122.6 ms