RNA–Protein interactions for RNA: YJL121C

RPE1, Transcript of D-ribulose-5-phosphate 3-epimerase, yeast

Gene RPE1, Length 717 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPE1	YJL121C	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPE1	YJL121C	VPS63	O13549	108 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPE1	YJL121C	YMR31	P19955	123 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPE1	YJL121C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPE1	YJL121C	SRP21	P32342	167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPE1	YJL121C	RPB11	P38902	120 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPE1	YJL121C	YJR015W	P47090	510 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPE1	YJL121C	DYN2	Q02647	92 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPE1	YJL121C	STD1	Q02794	444 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPE1	YJL121C	SHH3	Q04487	196 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPE1	YJL121C	YOR105W	Q08504	108 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPE1	YJL121C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPE1	YJL121C	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPE1	YJL121C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPE1	YJL121C	MRS3	P10566	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	TCA17	P32613	152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	YER084W	P40057	128 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	YIL163C	P40448	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	GLC8	P41818	229 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	DSK2	P48510	373 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	MIC27	P50945	234 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	LIP2	Q06005	328 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	MCH1	Q07376	486 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	PHD1	P36093	366 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	PRE3	P38624	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	ECM14	P38836	430 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	SRP14	P38985	146 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	DFG10	P40526	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	CPD1	P53314	239 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	YPL067C	Q02754	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	LPP1	Q04396	274 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	NAT5	Q08689	176 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	ISU2	Q12056	156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	CCW14	O13547	238 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	DAL80	P26343	269 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	YBR184W	P38299	523 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	SIP18	P50263	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	DUG3	P53871	357 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	CRZ1	P53968	678 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	SED1	Q01589	338 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	RFM1	Q12192	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	SPO24	Q3E752	67 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	QRI5	P32344	111 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	YOX1	P34161	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	YKL102C	P34249	101 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	PAM17	P36147	197 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	YBR090C	P38253	122 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	UIP3	P39547	235 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	YER134C	P40081	178 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	GON7	P46984	123 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	UBC13	P52490	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	IZH1	Q03419	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	POS5	Q06892	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	YOS1	Q3E834	85 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	VMA16	P23968	213 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	PAU16	P35994	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	NNK1	P36003	928 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	YMR166C	Q03829	368 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	YHP1	Q04116	353 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	YDR114C	Q04597	100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	HAP3	P13434	144 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	CUP2	P15315	225 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	FPR2	P32472	135 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	MIX23	P38162	196 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	AME1	P38313	324 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	DOG1	P38774	246 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	YAR068W	P39564	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	YER121W	P40076	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	SAS2	P40963	338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	RPA43	P46669	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	YJL028W	P47062	111 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPE1	YJL121C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	PMU1	P36069	295 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YHL044W	P38727	235 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YHR173C	P38864	112 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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