RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 ARMC4Q5T2S8 1044 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 C7orf31Q8N865 590 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 AP5M1Q9H0R1 490 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 GJA3Q9Y6H8 435 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 PLA2G4AP47712 749 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 CHRNDQ07001 517 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 SMCO1Q147U7 214 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 NR1I3Q14994 352 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 WDR93Q6P2C0 686 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 SLC25A13Q9UJS0 675 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 AP3M1Q9Y2T2 418 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 USP1O94782 785 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 ARL4DP49703 201 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC36Q1X8D7 754 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 C1orf50Q9BV19 199 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 IRAK3Q9Y616 596 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 MGRN1O60291 552 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 CALB2P22676 271 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 SNX17Q15036 470 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 KCTD1Q719H9 257 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 FAM160B2Q86V87 743 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 SHCBP1Q8NEM2 672 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 GANCQ8TET4 914 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 TIPINQ9BVW5 301 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 SMCO3A2RU48 225 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 BMP3P12645 472 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 KCNK10P57789 538 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 CAMKK2Q96RR4 588 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 GNA13Q14344 377 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 JADE3Q92613 823 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 MAN1C1Q9NR34 630 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 ETAA1Q9NY74 926 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM10Q9UDY6 481 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 GLI2P10070 1586 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 NAB2Q15742 525 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 SP110Q9HB58 689 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 DKK3Q9UBP4 350 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 PRELPP51888 382 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 GTF2IP78347 998 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 CENPCQ03188 943 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 TAF2Q6P1X5 1199 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 C17orf80Q9BSJ5 609 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 MAPRE3Q9UPY8 281 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 NEU2Q9Y3R4 380 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 SNX9Q9Y5X1 595 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 UBE2QL1A1L167 161 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 B2RBV5 119 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 ALDH1A1P00352 501 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 COMMD9Q9P000 198 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 ANKARQ7Z5J8 1434 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 PIPSLA2A3N6 862 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 PTK7Q13308 1070 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 EFR3AQ14156 821 aa7.25□□□□□ -1.25
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