RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000079702.3

Cbx1-202, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tmem63cQ8CBX0 802 aa12.9□□□□□ -0.34
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gas2l1Q8JZP9 678 aa12.9□□□□□ -0.34
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Sgms1Q8VCQ6 419 aa12.9□□□□□ -0.34
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fam111aQ9D2L9 613 aa12.9□□□□□ -0.34
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rnf6Q9DBU5 667 aa12.9□□□□□ -0.34
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Sorbs3Q9R1Z8 733 aa12.9□□□□□ -0.34
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tnni1Q9WUZ5 187 aa12.9□□□□□ -0.34
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm9573F7C950 1606 aa12.9□□□□□ -0.34
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ism1A2ATD1 454 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tmem215A7E1Z1 235 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Usp35M0QWN7 1009 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fam167bP17257 162 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Lmo2P25801 158 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Nub1P54729 614 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Abi2P62484 446 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Hmgb1P63158 215 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fubp3Q3TIX6 575 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Lrrc47Q505F5 581 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Klra6Q60653 266 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 PostnQ62009 838 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 RbfaQ6P3B9 350 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Slc39a10Q6P5F6 833 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tatdn1Q6P8M1 295 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rhbdf1Q6PIX5 856 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ttc24Q8BYG0 334 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Brat1Q8C3R1 822 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fbxo43Q8CDI2 640 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ccdc73Q8CDM4 1066 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pym1Q8CHP5 203 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Golph3lQ8R088 285 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Igsf8Q8R366 611 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Txndc5Q91W90 417 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 CbsQ91WT9 561 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pcdhb18Q91Y02 792 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ackr4Q924I3 350 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Card14Q99KF0 999 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mtif3Q9CZD5 276 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rassf7Q9DD19 359 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Sept5Q9Z2Q6 369 aa12.89□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Plekhg4A0A1L1SU27 1217 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dmrta2A2A9A2 531 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rap1gapA2ALS5 663 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Skint6A7XUZ6 1240 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm4846B2RWH8 538 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ces1bD3Z5G7 567 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Alkbh1P0CB42 389 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 PdgfbP31240 241 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Flt3lgP49772 232 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pdrg1P59048 133 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Psmc1P62192 440 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cdh8P97291 799 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 MylpfP97457 169 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Prss55Q14BX2 321 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Upf3bQ3ULL6 472 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Bdkrb1Q61125 334 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ltbp3Q61810 1268 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pde1cQ64338 706 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gpsm1Q6IR34 673 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Polr3gQ6NXY9 223 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Zfp512bQ6PHP4 879 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Anks1bQ8BIZ1 1259 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 FsbpQ8BKE5 299 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gpr180Q8BPS4 441 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Scyl2Q8CFE4 930 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rtn4rl1Q8K0S5 445 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Calhm5Q8R100 309 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Taf6lQ8R2K4 616 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Nmrk1Q91W63 195 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Sh3d19Q91X43 789 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pde2aQ922S4 916 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mms19Q9D071 1031 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Slc22a17Q9D9E0 401 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pak1ip1Q9DCE5 382 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Timp4Q9JHB3 224 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Arhgef10Q8C033 1345 aa12.88□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 1700031M16RikA0A087WSH0 82 aa12.87□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr1023A2ASU6 311 aa12.87□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm11758A2BEI6 360 aa12.87□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm11757A2BEI8 360 aa12.87□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm5160F8VPN3 147 aa12.87□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Stx1aO35526 288 aa12.87□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Nek1P51954 1203 aa12.87□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Uchl4P58321 233 aa12.87□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Igbp1Q61249 340 aa12.87□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cntn2Q61330 1040 aa12.87□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dsg1aQ61495 1057 aa12.87□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 EregQ61521 162 aa12.87□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Papd5Q68ED3 633 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cpa4Q6P8K8 420 aa12.87□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tmem164Q6PHN7 296 aa12.87□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mindy1Q76LS9 468 aa12.87□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr1080Q7TR67 313 aa12.87□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Otop2Q80SX5 563 aa12.87□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cfap100Q80VN0 613 aa12.87□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Slc7a14Q8BXR1 771 aa12.87□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Samd7Q8C8Y5 445 aa12.87□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gnl3Q8CI11 538 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mfsd14bQ8CIA9 507 aa12.87□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 AdigQ8R400 80 aa12.87□□□□□ -0.35
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Nxnl1Q8VC33 217 aa12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.1 ms