Protein–RNA interactions for Protein: Q6IR34

Gpsm1, G-protein-signaling modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpsm1Q6IR34 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
Gpsm1Q6IR34 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Gpsm1Q6IR34 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Gpsm1Q6IR34 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Gpsm1Q6IR34 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Gpsm1Q6IR34 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Gpsm1Q6IR34 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Gpsm1Q6IR34 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Gpsm1Q6IR34 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Gpsm1Q6IR34 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Gpsm1Q6IR34 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Gpsm1Q6IR34 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Gpsm1Q6IR34 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Gpsm1Q6IR34 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Gpsm1Q6IR34 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Gpsm1Q6IR34 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Gpsm1Q6IR34 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Gpsm1Q6IR34 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Gpsm1Q6IR34 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Gpsm1Q6IR34 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Gpsm1Q6IR34 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Gpsm1Q6IR34 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Gpsm1Q6IR34 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Gpsm1Q6IR34 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Gpsm1Q6IR34 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Gpsm1Q6IR34 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Gpsm1Q6IR34 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Gpsm1Q6IR34 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Gpsm1Q6IR34 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Gpsm1Q6IR34 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Gpsm1Q6IR34 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Gpsm1Q6IR34 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Gpsm1Q6IR34 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Gpsm1Q6IR34 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Gpsm1Q6IR34 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Gpsm1Q6IR34 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Gpsm1Q6IR34 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Gpsm1Q6IR34 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Gpsm1Q6IR34 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Gpsm1Q6IR34 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Gpsm1Q6IR34 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Gpsm1Q6IR34 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Gpsm1Q6IR34 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Gpsm1Q6IR34 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Gpsm1Q6IR34 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Gpsm1Q6IR34 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Gpsm1Q6IR34 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gpsm1Q6IR34 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Gpsm1Q6IR34 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Gpsm1Q6IR34 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Gpsm1Q6IR34 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Gpsm1Q6IR34 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Gpsm1Q6IR34 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Gpsm1Q6IR34 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Gpsm1Q6IR34 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Gpsm1Q6IR34 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Gpsm1Q6IR34 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Gpsm1Q6IR34 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gpsm1Q6IR34 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gpsm1Q6IR34 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gpsm1Q6IR34 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Gpsm1Q6IR34 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Gpsm1Q6IR34 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gpsm1Q6IR34 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gpsm1Q6IR34 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gpsm1Q6IR34 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gpsm1Q6IR34 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Gpsm1Q6IR34 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gpsm1Q6IR34 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Gpsm1Q6IR34 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Gpsm1Q6IR34 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gpsm1Q6IR34 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Gpsm1Q6IR34 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Gpsm1Q6IR34 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Gpsm1Q6IR34 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Gpsm1Q6IR34 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Gpsm1Q6IR34 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gpsm1Q6IR34 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gpsm1Q6IR34 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Gpsm1Q6IR34 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Gpsm1Q6IR34 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gpsm1Q6IR34 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gpsm1Q6IR34 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gpsm1Q6IR34 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gpsm1Q6IR34 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gpsm1Q6IR34 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gpsm1Q6IR34 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gpsm1Q6IR34 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gpsm1Q6IR34 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gpsm1Q6IR34 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gpsm1Q6IR34 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gpsm1Q6IR34 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gpsm1Q6IR34 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gpsm1Q6IR34 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gpsm1Q6IR34 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gpsm1Q6IR34 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gpsm1Q6IR34 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gpsm1Q6IR34 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Gpsm1Q6IR34 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gpsm1Q6IR34 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms