Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD19

Rassf7, Ras association domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf7Q9DD19 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
Rassf7Q9DD19 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rassf7Q9DD19 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Rassf7Q9DD19 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Rassf7Q9DD19 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rassf7Q9DD19 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Rassf7Q9DD19 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Rassf7Q9DD19 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rassf7Q9DD19 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rassf7Q9DD19 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rassf7Q9DD19 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rassf7Q9DD19 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rassf7Q9DD19 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Rassf7Q9DD19 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rassf7Q9DD19 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rassf7Q9DD19 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rassf7Q9DD19 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Rassf7Q9DD19 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Rassf7Q9DD19 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rassf7Q9DD19 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rassf7Q9DD19 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rassf7Q9DD19 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Rassf7Q9DD19 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rassf7Q9DD19 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rassf7Q9DD19 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Rassf7Q9DD19 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rassf7Q9DD19 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rassf7Q9DD19 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rassf7Q9DD19 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rassf7Q9DD19 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Rassf7Q9DD19 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Rassf7Q9DD19 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Rassf7Q9DD19 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Rassf7Q9DD19 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Rassf7Q9DD19 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Rassf7Q9DD19 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rassf7Q9DD19 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Rassf7Q9DD19 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rassf7Q9DD19 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rassf7Q9DD19 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rassf7Q9DD19 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rassf7Q9DD19 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rassf7Q9DD19 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rassf7Q9DD19 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rassf7Q9DD19 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rassf7Q9DD19 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rassf7Q9DD19 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rassf7Q9DD19 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rassf7Q9DD19 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rassf7Q9DD19 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Rassf7Q9DD19 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rassf7Q9DD19 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rassf7Q9DD19 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rassf7Q9DD19 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rassf7Q9DD19 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rassf7Q9DD19 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rassf7Q9DD19 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rassf7Q9DD19 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rassf7Q9DD19 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rassf7Q9DD19 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rassf7Q9DD19 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rassf7Q9DD19 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rassf7Q9DD19 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Rassf7Q9DD19 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rassf7Q9DD19 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rassf7Q9DD19 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rassf7Q9DD19 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Rassf7Q9DD19 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rassf7Q9DD19 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rassf7Q9DD19 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rassf7Q9DD19 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rassf7Q9DD19 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Rassf7Q9DD19 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rassf7Q9DD19 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rassf7Q9DD19 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rassf7Q9DD19 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rassf7Q9DD19 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rassf7Q9DD19 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rassf7Q9DD19 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rassf7Q9DD19 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Rassf7Q9DD19 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rassf7Q9DD19 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rassf7Q9DD19 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rassf7Q9DD19 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rassf7Q9DD19 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Rassf7Q9DD19 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rassf7Q9DD19 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rassf7Q9DD19 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Rassf7Q9DD19 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Rassf7Q9DD19 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rassf7Q9DD19 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rassf7Q9DD19 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rassf7Q9DD19 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rassf7Q9DD19 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rassf7Q9DD19 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rassf7Q9DD19 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rassf7Q9DD19 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rassf7Q9DD19 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rassf7Q9DD19 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Rassf7Q9DD19 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms