Protein–RNA interactions for Protein: Q91WT9

Cbs, Cystathionine beta-synthase, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbsQ91WT9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.57■■■■□ 3.93
CbsQ91WT9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CbsQ91WT9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CbsQ91WT9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CbsQ91WT9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CbsQ91WT9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CbsQ91WT9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
CbsQ91WT9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
CbsQ91WT9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CbsQ91WT9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CbsQ91WT9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CbsQ91WT9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CbsQ91WT9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CbsQ91WT9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CbsQ91WT9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CbsQ91WT9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CbsQ91WT9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CbsQ91WT9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CbsQ91WT9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CbsQ91WT9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
CbsQ91WT9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CbsQ91WT9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CbsQ91WT9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CbsQ91WT9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CbsQ91WT9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CbsQ91WT9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CbsQ91WT9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
CbsQ91WT9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CbsQ91WT9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CbsQ91WT9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CbsQ91WT9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CbsQ91WT9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CbsQ91WT9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CbsQ91WT9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CbsQ91WT9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CbsQ91WT9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CbsQ91WT9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CbsQ91WT9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.77
CbsQ91WT9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CbsQ91WT9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
CbsQ91WT9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CbsQ91WT9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CbsQ91WT9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CbsQ91WT9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
CbsQ91WT9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
CbsQ91WT9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CbsQ91WT9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CbsQ91WT9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CbsQ91WT9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CbsQ91WT9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CbsQ91WT9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CbsQ91WT9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CbsQ91WT9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CbsQ91WT9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
CbsQ91WT9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CbsQ91WT9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CbsQ91WT9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CbsQ91WT9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
CbsQ91WT9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CbsQ91WT9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CbsQ91WT9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CbsQ91WT9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
CbsQ91WT9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
CbsQ91WT9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CbsQ91WT9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CbsQ91WT9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CbsQ91WT9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CbsQ91WT9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CbsQ91WT9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CbsQ91WT9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CbsQ91WT9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CbsQ91WT9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CbsQ91WT9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CbsQ91WT9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CbsQ91WT9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CbsQ91WT9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CbsQ91WT9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CbsQ91WT9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
CbsQ91WT9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
CbsQ91WT9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CbsQ91WT9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CbsQ91WT9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CbsQ91WT9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CbsQ91WT9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CbsQ91WT9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CbsQ91WT9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CbsQ91WT9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CbsQ91WT9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CbsQ91WT9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CbsQ91WT9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CbsQ91WT9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CbsQ91WT9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CbsQ91WT9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CbsQ91WT9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CbsQ91WT9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CbsQ91WT9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CbsQ91WT9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CbsQ91WT9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CbsQ91WT9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CbsQ91WT9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms