Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
Lmo2P25801 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Lmo2P25801 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Lmo2P25801 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Lmo2P25801 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Lmo2P25801 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Lmo2P25801 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Lmo2P25801 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Lmo2P25801 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Lmo2P25801 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Lmo2P25801 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Lmo2P25801 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Lmo2P25801 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lmo2P25801 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Lmo2P25801 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Lmo2P25801 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Lmo2P25801 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
Lmo2P25801 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Lmo2P25801 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lmo2P25801 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lmo2P25801 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lmo2P25801 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Lmo2P25801 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lmo2P25801 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lmo2P25801 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lmo2P25801 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lmo2P25801 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Lmo2P25801 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Lmo2P25801 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lmo2P25801 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lmo2P25801 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lmo2P25801 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Lmo2P25801 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
Lmo2P25801 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Lmo2P25801 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Lmo2P25801 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Lmo2P25801 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Lmo2P25801 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Lmo2P25801 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Lmo2P25801 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Lmo2P25801 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Lmo2P25801 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Lmo2P25801 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Lmo2P25801 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Lmo2P25801 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Lmo2P25801 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lmo2P25801 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lmo2P25801 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lmo2P25801 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Lmo2P25801 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Lmo2P25801 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Lmo2P25801 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Lmo2P25801 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Lmo2P25801 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Lmo2P25801 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Lmo2P25801 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Lmo2P25801 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Lmo2P25801 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Lmo2P25801 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Lmo2P25801 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Lmo2P25801 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Lmo2P25801 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Lmo2P25801 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Lmo2P25801 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lmo2P25801 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lmo2P25801 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lmo2P25801 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Lmo2P25801 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lmo2P25801 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Lmo2P25801 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Lmo2P25801 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lmo2P25801 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lmo2P25801 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lmo2P25801 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Lmo2P25801 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lmo2P25801 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Lmo2P25801 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Lmo2P25801 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lmo2P25801 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lmo2P25801 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Lmo2P25801 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lmo2P25801 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lmo2P25801 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lmo2P25801 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lmo2P25801 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lmo2P25801 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Lmo2P25801 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lmo2P25801 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lmo2P25801 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lmo2P25801 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lmo2P25801 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lmo2P25801 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lmo2P25801 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lmo2P25801 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lmo2P25801 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Lmo2P25801 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lmo2P25801 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lmo2P25801 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lmo2P25801 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Lmo2P25801 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms