Protein–RNA interactions for Protein: A2ALS5

Rap1gap, Rap1 GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rap1gapA2ALS5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
Rap1gapA2ALS5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rap1gapA2ALS5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rap1gapA2ALS5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rap1gapA2ALS5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Rap1gapA2ALS5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Rap1gapA2ALS5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Rap1gapA2ALS5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Rap1gapA2ALS5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Rap1gapA2ALS5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rap1gapA2ALS5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rap1gapA2ALS5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rap1gapA2ALS5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Rap1gapA2ALS5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Rap1gapA2ALS5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Rap1gapA2ALS5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rap1gapA2ALS5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rap1gapA2ALS5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rap1gapA2ALS5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rap1gapA2ALS5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rap1gapA2ALS5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rap1gapA2ALS5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rap1gapA2ALS5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rap1gapA2ALS5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rap1gapA2ALS5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rap1gapA2ALS5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Rap1gapA2ALS5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rap1gapA2ALS5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rap1gapA2ALS5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Rap1gapA2ALS5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rap1gapA2ALS5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rap1gapA2ALS5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rap1gapA2ALS5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rap1gapA2ALS5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rap1gapA2ALS5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rap1gapA2ALS5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Rap1gapA2ALS5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rap1gapA2ALS5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rap1gapA2ALS5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rap1gapA2ALS5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rap1gapA2ALS5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rap1gapA2ALS5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rap1gapA2ALS5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rap1gapA2ALS5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Rap1gapA2ALS5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rap1gapA2ALS5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Rap1gapA2ALS5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Rap1gapA2ALS5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rap1gapA2ALS5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rap1gapA2ALS5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Rap1gapA2ALS5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rap1gapA2ALS5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rap1gapA2ALS5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rap1gapA2ALS5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rap1gapA2ALS5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rap1gapA2ALS5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Rap1gapA2ALS5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Rap1gapA2ALS5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rap1gapA2ALS5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rap1gapA2ALS5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rap1gapA2ALS5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rap1gapA2ALS5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rap1gapA2ALS5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rap1gapA2ALS5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rap1gapA2ALS5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rap1gapA2ALS5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rap1gapA2ALS5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rap1gapA2ALS5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rap1gapA2ALS5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rap1gapA2ALS5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rap1gapA2ALS5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Rap1gapA2ALS5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rap1gapA2ALS5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rap1gapA2ALS5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rap1gapA2ALS5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rap1gapA2ALS5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Rap1gapA2ALS5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Rap1gapA2ALS5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rap1gapA2ALS5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rap1gapA2ALS5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rap1gapA2ALS5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rap1gapA2ALS5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rap1gapA2ALS5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rap1gapA2ALS5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Rap1gapA2ALS5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rap1gapA2ALS5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rap1gapA2ALS5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Rap1gapA2ALS5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Rap1gapA2ALS5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rap1gapA2ALS5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rap1gapA2ALS5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rap1gapA2ALS5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rap1gapA2ALS5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rap1gapA2ALS5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rap1gapA2ALS5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rap1gapA2ALS5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rap1gapA2ALS5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rap1gapA2ALS5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rap1gapA2ALS5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rap1gapA2ALS5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms