RNA–Protein interactions for RNA: YLL003W

SFI1, Transcript of Centrin (Cdc31p)-binding protein required for SPB duplication, yeast

Gene SFI1, Length 2,841 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFI1	YLL003W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	KRE1	P17260	313 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	URA10	P30402	227 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	ECM14	P38836	430 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	ATG27	P46989	271 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	MTL1	P53214	551 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	BUD9	P53226	547 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	MOT1	P32333	1867 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	HEM4	P06174	275 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	CHO1	P08456	276 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	SAS2	P40963	338 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	UBX6	P47049	396 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	YLR152C	P54072	576 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	HSK3	P69852	69 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	GRX5	Q02784	150 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	YLR042C	Q07990	161 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	FIT3	Q08907	204 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	YDR029W	Q12111	104 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	YPL073C	P40323	161 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	YJL213W	P40896	331 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	PAU5	P43575	122 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	CAB4	P53332	305 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	IRC15	Q02733	499 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	FIG2	P25653	1609 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	BNI1	P41832	1953 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	PAU16	P35994	123 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	YNL198C	P40166	100 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	XBP1	P40489	647 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
SFI1	YLL003W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	CAX4	P53223	239 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	YGR219W	P53307	113 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	PHO89	P38361	574 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	YEL076C	P39971	216 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	SFT1	P43682	97 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	ADD37	Q03233	198 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	BET5	Q03630	159 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	RFM1	Q12192	310 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	IZH2	Q12442	317 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFI1	YLL003W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	MAK31	P23059	88 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	CYB5	P40312	120 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	CUP9	P41817	306 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	VPS71	Q03433	280 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	YMR103C	Q04436	120 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	YCR099C	P25657	155 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	EMC3	P36039	253 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	MED6	P38782	295 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	EGT2	P42835	1041 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	INP1	Q03694	420 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	RAF1	Q06891	181 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	DGA1	Q08650	418 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	GPI2	P46961	280 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	AIM25	P47140	327 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	EMC4	P53073	190 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	PRM8	P53174	237 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	SPR6	Q01684	191 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	MRS1	P07266	363 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	YCR085W	P25650	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	SPL2	P38839	148 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	PEP8	P40335	379 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	RRT5	P43607	289 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	CTK2	P46962	323 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SFI1	YLL003W	PUS2	P53167	370 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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