RNA–Protein interactions for RNA: YHR167W

THP2, Transcript of Subunit of the THO and TREX complexes, yeastyeast

Gene THP2, Length 786 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
THP2YHR167W SEN34P39707 275 aa2.55□□□□□ -2
THP2YHR167W YMR144WP40214 342 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
THP2YHR167W SYS1P41544 203 aa2.55□□□□□ -2
THP2YHR167W ERV25P54837 211 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
THP2YHR167W DID2P69771 204 aa2.55□□□□□ -2
THP2YHR167W YPL067CQ02754 198 aa2.55□□□□□ -2
THP2YHR167W YDC1Q02896 317 aa2.55□□□□□ -2
THP2YHR167W FIT1Q04433 528 aa2.55□□□□□ -2
THP2YHR167W MRX9Q07349 420 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
THP2YHR167W RRT7Q07829 113 aa2.55□□□□□ -2
THP2YHR167W RFU1Q08003 200 aa2.55□□□□□ -2
THP2YHR167W GEP5Q12393 293 aa2.55□□□□□ -2
THP2YHR167W YLR146W-AQ2V2P1 62 aa2.55□□□□□ -2
THP2YHR167W YGL194C-AQ2V2P6 80 aa2.55□□□□□ -2
THP2YHR167W YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa2.55□□□□□ -2
THP2YHR167W RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
THP2YHR167W RPS23BP0CX30 145 aa2.54□□□□□ -2
THP2YHR167W MATALPHA1P0CY06 175 aa2.54□□□□□ -2
THP2YHR167W HMLALPHA1P0CY07 175 aa2.54□□□□□ -2
THP2YHR167W PET54P10834 293 aa2.54□□□□□ -2
THP2YHR167W URA5P13298 226 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
THP2YHR167W ATG15P25641 520 aa2.54□□□□□ -2
THP2YHR167W TRR1P29509 319 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
THP2YHR167W SUA5P32579 426 aa2.54□□□□□ -2
THP2YHR167W FMT1P32785 401 aa2.54□□□□□ -2
THP2YHR167W RPS0AP32905 252 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
THP2YHR167W YBR096WP38256 230 aa2.54□□□□□ -2
THP2YHR167W BDH1P39714 382 aa2.54□□□□□ -2
THP2YHR167W SMB1P40018 196 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
THP2YHR167W PIR5P46999 287 aa2.54□□□□□ -2
THP2YHR167W YJR056CP47115 236 aa2.54□□□□□ -2
THP2YHR167W HCH1P53834 153 aa2.54□□□□□ -2
THP2YHR167W HSK3P69852 69 aa2.54□□□□□ -2
THP2YHR167W VPS28Q02767 242 aa2.54□□□□□ -2
THP2YHR167W LPP1Q04396 274 aa2.54□□□□□ -2
THP2YHR167W ECM18Q04623 453 aa2.54□□□□□ -2
THP2YHR167W RIM9Q04734 239 aa2.54□□□□□ -2
THP2YHR167W SCP1Q08873 200 aa2.54□□□□□ -2
THP2YHR167W DGK1Q12382 290 aa2.54□□□□□ -2
THP2YHR167W SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
THP2YHR167W CDC28P00546 298 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
THP2YHR167W SEN2P16658 377 aa2.53□□□□□ -2
THP2YHR167W DAL80P26343 269 aa2.53□□□□□ -2
THP2YHR167W OCH1P31755 480 aa2.53□□□□□ -2
THP2YHR167W AGA2P32781 87 aa2.53□□□□□ -2
THP2YHR167W YMR262WP38430 313 aa2.53□□□□□ -2
THP2YHR167W PRS2P38620 318 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
THP2YHR167W MRX5P47007 382 aa2.53□□□□□ -2
THP2YHR167W YJR111CP47148 283 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
THP2YHR167W NSA1P53136 463 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
THP2YHR167W YNR064CP53750 290 aa2.53□□□□□ -2
THP2YHR167W YMR279CQ03263 540 aa2.53□□□□□ -2
THP2YHR167W YMR244WQ04018 355 aa2.53□□□□□ -2
THP2YHR167W ECM19Q06011 112 aa2.53□□□□□ -2
THP2YHR167W KEI1Q06346 221 aa2.53□□□□□ -2
THP2YHR167W YOL118CQ08259 102 aa2.53□□□□□ -2
THP2YHR167W MPD1Q12404 318 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
THP2YHR167W DFM1Q12743 341 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
THP2YHR167W PET20Q99373 253 aa2.53□□□□□ -2
THP2YHR167W SSA3P09435 649 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
THP2YHR167W YCR101CP25607 182 aa2.52□□□□□ -2.01
THP2YHR167W RPB9P27999 122 aa2.52□□□□□ -2.01
THP2YHR167W ACB1P31787 87 aa2.52□□□□□ -2.01
THP2YHR167W KTI12P34253 313 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
THP2YHR167W SWD2P36104 329 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
THP2YHR167W UTP30P36144 274 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
THP2YHR167W RRF1P38771 230 aa2.52□□□□□ -2.01
THP2YHR167W RMD6P39975 231 aa2.52□□□□□ -2.01
THP2YHR167W GON7P46984 123 aa2.52□□□□□ -2.01
THP2YHR167W TTI2P47168 421 aa2.52□□□□□ -2.01
THP2YHR167W SOL1P50278 321 aa2.52□□□□□ -2.01
THP2YHR167W TPN1P53099 579 aa2.52□□□□□ -2.01
THP2YHR167W SDS23P53172 527 aa2.52□□□□□ -2.01
THP2YHR167W LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data2.52□□□□□ -2.01not detected
THP2YHR167W YDR391CQ04170 232 aa2.52□□□□□ -2.01
THP2YHR167W FCY1Q12178 158 aa2.52□□□□□ -2.01
THP2YHR167W RTR2Q12378 196 aa2.52□□□□□ -2.01
THP2YHR167W HUG1Q6Q5K6 68 aa2.52□□□□□ -2.01
THP2YHR167W CYR1P08678 2026 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
THP2YHR167W SLH1P53327 1967 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
THP2YHR167W ARG80P07249 177 aa2.51□□□□□ -2.01
THP2YHR167W RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
THP2YHR167W RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
THP2YHR167W YPS1P32329 569 aa2.51□□□□□ -2.01
THP2YHR167W RPB7P34087 171 aa2.51□□□□□ -2.01
THP2YHR167W YKL162CP36052 402 aa2.51□□□□□ -2.01
THP2YHR167W ERV15P38312 142 aa2.51□□□□□ -2.01
THP2YHR167W YGP1P38616 354 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
THP2YHR167W RFC2P40348 353 aa2.51□□□□□ -2.01
THP2YHR167W HIT1P46973 164 aa2.51□□□□□ -2.01
THP2YHR167W SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
THP2YHR167W GMC1Q04399 608 aa2.51□□□□□ -2.01
THP2YHR167W UPS1Q05776 175 aa2.51□□□□□ -2.01
THP2YHR167W YPR195CQ06594 109 aa2.51□□□□□ -2.01
THP2YHR167W BER1Q06688 274 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
THP2YHR167W YNG1Q08465 219 aa2.51□□□□□ -2.01
THP2YHR167W YOR029WQ12243 111 aa2.51□□□□□ -2.01
THP2YHR167W ATG5Q12380 294 aa2.51□□□□□ -2.01
THP2YHR167W QCR7P00128 127 aa2.5□□□□□ -2.01
THP2YHR167W SEC22P22214 214 aa2.5□□□□□ -2.01
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