RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-B

YHL009W-B, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YHL009W-B, Length 5,409 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-BYHL009W-B MBF1O14467 151 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B CDC37P06101 506 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B URA6P15700 204 aa-0.87□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B PHO85P17157 305 aa-0.87□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B ACP1P32463 125 aa-0.87□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B LTV1P34078 463 aa-0.87□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B RPC25P35718 212 aa-0.87□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B SDH4P37298 181 aa-0.87□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B HIS2P38635 335 aa-0.87□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B RPS27BP38711 82 aa-0.87□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B TDA4P47153 279 aa-0.87□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B COS5P47187 383 aa-0.87□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B RET3P53600 189 aa-0.87□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B ERP1Q05359 219 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B COS7Q07788 383 aa-0.87□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B RPN8Q08723 338 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B ISD11Q6Q560 94 aa-0.87□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B YCR090CP25654 182 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B COX23P38824 151 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B CHL4P38907 458 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B YEL028WP39989 153 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B TMA22P47089 198 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B RAF1Q06891 181 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B YHR213WP0CI67 198 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B GCN3P14741 305 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B EHD3P28817 500 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B SRB2P34162 210 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B UTP30P36144 274 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B DOG2P38773 246 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B DOG1P38774 246 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B SUR2P38992 349 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B RTT102P53330 157 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B PDR16P53860 351 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B YIL014C-AQ02598 104 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B VTA1Q06263 330 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B FDH1Q08911 376 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B SEY1Q99287 776 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B FAS1P07149 2051 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.88□□□□□ -2.55not detected
YHL009W-BYHL009W-B RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B RPL43BP0CX26 92 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B PET54P10834 293 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B YPT52P36018 234 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B YBR096WP38256 230 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B PET100P38958 111 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B YGR026WP53217 278 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B PRO2P54885 456 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B UBC7Q02159 165 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B LIP1Q03579 150 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B GTB1Q04924 702 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B RRT8Q08219 342 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B AAD15Q08361 143 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B ERV2Q12284 196 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B KRE5P22023 1365 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B MIX23P38162 196 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B SFT2P38166 215 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B OLA1P38219 394 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B IPI1P38803 334 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B YAL064WP39711 94 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B SMB1P40018 196 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B TOS8P53147 276 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B SCM3Q12334 223 aa-0.88□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B HYP2P23301 157 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B YOR385WQ08909 290 aa-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B IDP1P21954 428 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B BET1P22804 142 aa-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B YGL010WP25338 174 aa-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B COG3P40094 801 aa-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B YMR141CP40211 102 aa-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B VPS55P47111 140 aa-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B COS10P52924 374 aa-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B YDR391CQ04170 232 aa-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B MGR3Q04472 501 aa-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B SWC7Q06707 132 aa-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B NHP6AP11632 93 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B DEP1P31385 405 aa-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.89□□□□□ -2.55not detected
YHL009W-BYHL009W-B ASF2P32448 525 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B GSP1P32835 219 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B TIP20P33891 701 aa-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B NSG1P38837 291 aa-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B SOP4P39543 234 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B ERG28P40030 148 aa-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B RPL13BP40212 199 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B CUS2P53830 285 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B PET191Q02772 108 aa-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B YML018CQ03730 393 aa-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B ATG41Q12048 136 aa-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B YPR014CQ6B0W2 109 aa-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B VPS3P23643 1011 aa-0.89□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B TOM40P23644 387 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
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