RNA–Protein interactions for RNA: YGR059W

SPR3, Transcript of Sporulation-specific homolog of the CDC3/10/11/12 family of genes, yeast

Gene SPR3, Length 1,539 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPR3	YGR059W	TIR3	P40552	269 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	UBC12	P52491	188 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	YGL235W	P53071	178 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	JAC1	P53193	184 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	AIM34	Q03673	198 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	TRM12	Q04235	462 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	MCP1	Q12106	302 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	PEX11	Q12462	236 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	IQG1	Q12280	1495 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	STU1	P38198	1513 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	IML1	P47170	1584 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	REP2	P03872	296 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	QCR8	P08525	94 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	CNB1	P25296	175 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	AHC2	P25649	128 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	CLG1	P35190	452 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	FIG1	P38224	298 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	NVJ1	P38881	321 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	AIM2	P39721	246 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	MTW1	P39731	289 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	RSM25	P40496	264 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	YFH7	P43591	353 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	BOL2	P53082	120 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	YDR249C	Q03787	373 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	DGA1	Q08650	418 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	PSF1	Q12488	208 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.26
SPR3	YGR059W	TIM9	O74700	87 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	MRPS28	P21771	286 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	ARO7	P32178	256 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	DER1	P38307	211 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	ICE2	P40499	491 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	FMP32	P43557	207 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	AIF1	P52923	378 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	SWP1	Q02795	286 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	SHH4	Q06236	168 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	TSC3	Q3E790	80 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	PET20	Q99373	253 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	TOM1	Q03280	3268 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	ATP15	P21306	62 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	MEI4	P29467	408 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	YKL102C	P34249	101 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	MRPL17	P36528	281 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	OPY1	P38271	328 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	YEA4	P40004	342 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	SBH2	P52871	88 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	YDR274C	P87283	123 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	MAK3	Q03503	176 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	GPI17	Q04080	534 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	YLR031W	Q07978	186 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	YOL014W	Q08110	124 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	YLR053C	Q12026	108 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	YOR342C	Q12182	319 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	BCK1	Q01389	1478 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	GPA2	P10823	449 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	YCR023C	P25351	611 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	OCH1	P31755	480 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	FZF1	P32805	299 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	PGD1	P40356	397 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	SER2	P42941	309 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	EAF6	P47128	113 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	PGA1	P53896	198 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	HSK3	P69852	69 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	YDR476C	Q03362	224 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	PLP1	Q04004	230 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	DYN3	Q04949	312 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	YPR127W	Q06494	345 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	NSL1	Q12143	216 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	RDI1	Q12434	202 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	PDR18	P53756	1333 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	GCN2	P15442	1659 aa		0.87	□□□□□ -2.27
SPR3	YGR059W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27

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