RNA–Protein interactions for RNA: Q0144

Q0144, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene Q0144, Length 330 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
Q0144Q0144 YLR036CQ07986 203 aa-1.64□□□□□ -2.67
Q0144Q0144 MBF1O14467 151 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
Q0144Q0144 ASF2P32448 525 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
Q0144Q0144 RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
Q0144Q0144 YBR121C-AP0C5L4 52 aa-1.67□□□□□ -2.68
Q0144Q0144 RPS29BP41058 56 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
Q0144Q0144 DML1Q03652 475 aa-1.67□□□□□ -2.68
Q0144Q0144 RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
Q0144Q0144 NTG1P31378 399 aa-1.68□□□□□ -2.68
Q0144Q0144 TAF14P35189 244 aa-1.68□□□□□ -2.68
Q0144Q0144 RTC3P38804 111 aaPredicted RBP-1.68□□□□□ -2.68
Q0144Q0144 YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP-1.68□□□□□ -2.68
Q0144Q0144 ATG41Q12048 136 aa-1.68□□□□□ -2.68
Q0144Q0144 YKL183C-AQ3E765 70 aa-1.68□□□□□ -2.68
Q0144Q0144 SPS18P32572 300 aa-1.69□□□□□ -2.68
Q0144Q0144 AVO2Q04749 426 aa-1.69□□□□□ -2.68
Q0144Q0144 DAS2Q12084 232 aa-1.69□□□□□ -2.68
Q0144Q0144 YOR342CQ12182 319 aa-1.7□□□□□ -2.68
Q0144Q0144 RIF1P29539 1916 aa-1.71□□□□□ -2.68
Q0144Q0144 YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP-1.73□□□□□ -2.69
Q0144Q0144 YCR087C-AP37263 153 aa-1.74□□□□□ -2.69
Q0144Q0144 YRB1P41920 201 aaKnown RBP-1.74□□□□□ -2.69
Q0144Q0144 YFL019CP43576 117 aa-1.74□□□□□ -2.69
Q0144Q0144 TDA4P47153 279 aa-1.74□□□□□ -2.69
Q0144Q0144 GRX5Q02784 150 aa-1.74□□□□□ -2.69
Q0144Q0144 YLR031WQ07978 186 aa-1.74□□□□□ -2.69
Q0144Q0144 RFC4P40339 323 aaKnown RBP-1.75□□□□□ -2.69
Q0144Q0144 ATP20Q12233 115 aa-1.75□□□□□ -2.69
Q0144Q0144 TAO3P40468 2376 aa-1.76□□□□□ -2.69
Q0144Q0144 UBC6P33296 250 aaPredicted RBP-1.76□□□□□ -2.69
Q0144Q0144 SLM6P38343 150 aa-1.76□□□□□ -2.69
Q0144Q0144 HAP2P06774 265 aa-1.77□□□□□ -2.69
Q0144Q0144 RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP-1.77□□□□□ -2.69
Q0144Q0144 RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP-1.77□□□□□ -2.69
Q0144Q0144 HRD1Q08109 551 aa-1.77□□□□□ -2.69
Q0144Q0144 RRT1P38192 103 aa-1.78□□□□□ -2.69
Q0144Q0144 NSA2P40078 261 aaKnown RBP-1.78□□□□□ -2.69
Q0144Q0144 APS3P47064 194 aa-1.78□□□□□ -2.69
Q0144Q0144 YNL194CP40169 301 aa-1.79□□□□□ -2.7
Q0144Q0144 CCC1P47818 322 aa-1.79□□□□□ -2.7
Q0144Q0144 VAM10Q08474 114 aa-1.79□□□□□ -2.7
Q0144Q0144 YER085CP40058 173 aa-1.8□□□□□ -2.7
Q0144Q0144 RFC2P40348 353 aa-1.8□□□□□ -2.7
Q0144Q0144 BLM10P43583 2143 aa-1.81□□□□□ -2.7
Q0144Q0144 YDR157WA0A023PZE8 133 aa-1.81□□□□□ -2.7
Q0144Q0144 PRP18P33411 251 aaPredicted RBP-1.81□□□□□ -2.7
Q0144Q0144 YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data-1.82□□□□□ -2.7not detected
Q0144Q0144 TMA22P47089 198 aaPredicted RBP-1.82□□□□□ -2.7
Q0144Q0144 HTD2P38790 280 aaKnown RBP-1.84□□□□□ -2.7
Q0144Q0144 YHR140WP38842 239 aa-1.84□□□□□ -2.7
Q0144Q0144 SBH1P52870 82 aa-1.84□□□□□ -2.7
Q0144Q0144 NRK1P53915 240 aa-1.84□□□□□ -2.7
Q0144Q0144 YOR034C-AQ3E735 80 aa-1.85□□□□□ -2.71
Q0144Q0144 STE18P18852 110 aa-1.86□□□□□ -2.71
Q0144Q0144 ADE1P27616 306 aa-1.86□□□□□ -2.71
Q0144Q0144 YBR027CP38220 110 aa-1.86□□□□□ -2.71
Q0144Q0144 FMP23P38231 175 aa-1.86□□□□□ -2.71
Q0144Q0144 GPI17Q04080 534 aa-1.86□□□□□ -2.71
Q0144Q0144 NCB2Q92317 146 aa-1.86□□□□□ -2.71
Q0144Q0144 CBT1P36038 271 aaPredicted RBP-1.87□□□□□ -2.71
Q0144Q0144 YOR381W-AQ3E804 55 aa-1.87□□□□□ -2.71
Q0144Q0144 SNF2P22082 1703 aa-1.88□□□□□ -2.71
Q0144Q0144 RTR1P40084 226 aaPredicted RBP-1.88□□□□□ -2.71
Q0144Q0144 GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data-1.89□□□□□ -2.71not detected
Q0144Q0144 RAD17P48581 401 aa-1.89□□□□□ -2.71
Q0144Q0144 RIM9Q04734 239 aa-1.89□□□□□ -2.71
Q0144Q0144 YLR412C-AQ3E742 68 aa-1.89□□□□□ -2.71
Q0144Q0144 MRS1P07266 363 aa-1.9□□□□□ -2.71
Q0144Q0144 CWC23P52868 283 aaPredicted RBP-1.9□□□□□ -2.71
Q0144Q0144 YDL157CQ12082 118 aa-1.9□□□□□ -2.71
Q0144Q0144 NHP6BP11633 99 aaKnown RBP-1.91□□□□□ -2.72
Q0144Q0144 NSG1P38837 291 aa-1.91□□□□□ -2.72
Q0144Q0144 TAF2P23255 1407 aa-1.91□□□□□ -2.72
Q0144Q0144 IKI1P38874 309 aa-1.93□□□□□ -2.72
Q0144Q0144 RUD3Q12234 484 aaKnown RBP-1.93□□□□□ -2.72
Q0144Q0144 GAL83Q04739 417 aa-1.95□□□□□ -2.72
Q0144Q0144 HSP30P25619 332 aa-1.97□□□□□ -2.72
Q0144Q0144 RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP-1.98□□□□□ -2.73
Q0144Q0144 GEP7P53171 287 aa-1.98□□□□□ -2.73
Q0144Q0144 YNL184CP53876 108 aa-1.98□□□□□ -2.73
Q0144Q0144 RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP-1.98□□□□□ -2.73
Q0144Q0144 YGR269WP40326 108 aa-1.99□□□□□ -2.73
Q0144Q0144 OTU1P43558 301 aa-2□□□□□ -2.73
Q0144Q0144 YML079WQ03629 201 aa-2□□□□□ -2.73
Q0144Q0144 INO80P53115 1489 aa-2.01□□□□□ -2.73
Q0144Q0144 CDC33P07260 213 aaKnown RBP-2.01□□□□□ -2.73
Q0144Q0144 YMR321CQ04898 105 aa-2.02□□□□□ -2.73
Q0144Q0144 LAA1P39526 2014 aa-2.03□□□□□ -2.73
Q0144Q0144 COQ1P18900 473 aa-2.04□□□□□ -2.74
Q0144Q0144 RFA3P26755 122 aaKnown RBP-2.04□□□□□ -2.74
Q0144Q0144 FMN1Q03778 218 aa-2.04□□□□□ -2.74
Q0144Q0144 GLC8P41818 229 aa-2.05□□□□□ -2.74
Q0144Q0144 PAC10P48363 199 aa-2.05□□□□□ -2.74
Q0144Q0144 VPS28Q02767 242 aa-2.05□□□□□ -2.74
Q0144Q0144 YPR014CQ6B0W2 109 aa-2.06□□□□□ -2.74
Q0144Q0144 ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data-2.07□□□□□ -2.74not detected
Q0144Q0144 MVB12P42939 101 aa-2.08□□□□□ -2.74
Q0144Q0144 IGO2Q9P305 131 aa-2.08□□□□□ -2.74
Q0144Q0144 PGA1P53896 198 aa-2.09□□□□□ -2.74
Q0144Q0144 URA2P07259 2214 aaKnown RBP-2.1□□□□□ -2.75
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 118.8 ms