RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273598.7

NICN1-201, Transcript of nicolin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NICN1, Length 2,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-201ENST00000273598 CD101Q93033 1021 aa15.52■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 TMEM176AQ96HP8 235 aa15.52■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 VRTNQ9H8Y1 702 aa15.52■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 PCDHGC3Q9UN70 934 aa15.52■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 CILPO75339 1184 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 PAEPP09466 180 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 PYGMP11217 842 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 CLUL1Q15846 466 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 RSPH3Q86UC2 560 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 RUBCNQ92622 972 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 TWNKQ96RR1 684 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 AMACRQ9UHK6 382 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 USTQ9Y2C2 406 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 DERAQ9Y315 318 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 SNX9Q9Y5X1 595 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 CTSHP09668 335 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 SLC1A1P43005 524 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 PTP4A2Q12974 167 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 LLGL1Q15334 1064 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 DENND1BQ6P3S1 775 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 DCUN1D2Q6PH85 259 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 SESTD1Q86VW0 696 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 SLC4A11Q8NBS3 891 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 CCDC26Q8TAB7 109 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 FEZF2Q8TBJ5 459 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 ELOVL4Q9GZR5 314 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 RNF186Q9NXI6 227 aa15.51■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 TOMM70O94826 608 aa15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 CTNNA2P26232 953 aa15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 DNAJC24Q6P3W2 148 aa15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 WDTC1Q8N5D0 677 aa15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 WHAMMQ8TF30 809 aa15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 PLVAPQ9BX97 442 aa15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 RNF39Q9H2S5 420 aa15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 SYNCQ9H7C4 482 aa15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 NR2E1Q9Y466 385 aa15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 CDY2AQ9Y6F7 541 aa15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 TRPA1O75762 1119 aa15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 PROSCO94903 275 aa15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 ASGR1P07306 291 aa15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 HOXC8P31273 242 aa15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 PLA2G4AP47712 749 aa15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 NDST1P52848 882 aa15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 CAP1Q01518 475 aa15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 CYP4A22Q5TCH4 519 aa15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 MAATS1Q7Z4T9 603 aa15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 TRIP11Q15643 1979 aa15.5■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 MAP2K7O14733 419 aa15.49■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 PPEF2O14830 753 aa15.49■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 KCNA10Q16322 511 aa15.49■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 FAM228AQ86W67 206 aa15.49■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 CNTN3Q9P232 1028 aa15.49■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 RPS6KA5O75582 802 aa15.49■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 GJC1P36383 396 aa15.49■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 CARSP49589 748 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa15.49■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 MCEEQ96PE7 176 aa15.49■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 NT5C1AQ9BXI3 368 aa15.49■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa15.49■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 FAM53CQ9NYF3 392 aa15.49■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 NFU1Q9UMS0 254 aa15.49■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 IPPQ9Y573 584 aa15.49■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa15.48■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 GOLGA8SH3BPF8 625 aa15.48■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 GPS2Q13227 327 aa15.48■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 ZBTB6Q15916 424 aa15.48■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 SGO2Q562F6 1265 aa15.48■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 UBXN11Q5T124 520 aa15.48■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 LHX5Q9H2C1 402 aa15.48■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 ERVK-5Q9HDB9 667 aa15.48■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 GDF3Q9NR23 364 aa15.48■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 TRPV2Q9Y5S1 764 aa15.48■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 M0QYV0 167 aa15.48■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 STAU1O95793 577 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
NICN1-201ENST00000273598 VDRP11473 427 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms