RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 HPDLQ96IR7 371 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 GNRH1P01148 92 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 AMPD2Q01433 879 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PRKG1Q13976 671 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 AFG1LQ8WV93 481 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 EPN3Q9H201 632 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 DCDC2Q9UHG0 476 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 RPS6KA5O75582 802 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PPP1R37O75864 691 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 SPRP35270 261 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 MAPK9P45984 424 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 AP2B1P63010 937 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ZFATQ9P243 1243 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 C4BP0C0L5 1744 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 TTC36A6NLP5 189 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 SFI1A8K8P3 1242 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 EFCAB14O75071 495 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 FAM200BP0CF97 657 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 CYP27A1Q02318 531 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.359e-6■■■■□ 20.6
SETX-201ENST00000224140 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 LRRC52Q8N7C0 313 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 CGRRF1Q99675 332 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 OPLAHO14841 1288 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 NUGGCQ68CJ6 796 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 GJB4Q9NTQ9 266 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 GPD1P21695 349 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 HADHBP55084 474 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 CCL15Q16663 113 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PHC3Q8NDX5 983 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ADCY3O60266 1144 aa6.64□□□□□ -1.35
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SETX-201ENST00000224140 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 CENPKQ9BS16 269 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 COLEC11Q9BWP8 271 aa6.64□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.351e-8■■■□□ 15.3
SETX-201ENST00000224140 SLITRK3O94933 977 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 GLI1P08151 1106 aa6.63□□□□□ -1.35
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SETX-201ENST00000224140 C2CD2Q9Y426 696 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PAPPAQ13219 1627 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 DOCK2Q92608 1830 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 EPHB1P54762 984 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 TEX12Q9BXU0 123 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 M0QYV0 167 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 ITGA4P13612 1032 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 CYP11B1P15538 503 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 EPHX2P34913 555 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
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SETX-201ENST00000224140 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
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SETX-201ENST00000224140 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 FAM47DPA6NHR8 397 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 TEX33O43247 280 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 LCA5LO95447 670 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 MYL4P12829 197 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 CD58P19256 250 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 TPI1P60174 286 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 PTENP60484 403 aa6.63□□□□□ -1.35
SETX-201ENST00000224140 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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