RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M THI74Q04083 370 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M SCW10Q04951 389 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M PEX10Q05568 337 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M SYM1Q06563 197 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M RXT3Q07458 294 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M PAM18Q07914 168 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M RKI1Q12189 258 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M YBR255C-AQ3E776 120 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M BOL1Q3E793 110 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M COX2P00410 251 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M GPM1P00950 247 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M MRS3P10566 314 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M CAP2P13517 287 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M UTR5P32630 166 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M SEC66P33754 206 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M SDH4P37298 181 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M LAG1P38703 411 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M IPI1P38803 334 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M MPC2P38857 129 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M YAR068WP39564 161 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M IRC24P40580 263 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M YGR210CP42942 411 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M AGX1P43567 385 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M YGR219WP53307 113 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M NCE103P53615 221 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR274CP87283 123 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M VPS28Q02767 242 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M SPO19Q03029 223 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M EST3Q03096 181 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M RCF1Q03713 159 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M TRI1Q05024 226 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M RRG8Q06109 277 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M MCM21Q06675 368 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M YPR013CQ12145 317 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M PAA1Q12447 191 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M AGC1Q12482 902 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M YOR011W-AQ3E807 68 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M TAR1Q8TGM6 124 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M CYC1P00044 109 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M CPR4P25334 318 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M ALK2P32789 676 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M MBA1P38300 278 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M ERV15P38312 142 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M MIC12P38341 106 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M DOG2P38773 246 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M DOG1P38774 246 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M NSA2P40078 261 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M CAF16P43569 289 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M YPI1P43587 155 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M ERG25P53045 309 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M YGR025WP53216 100 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M GTF1P53260 183 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M SSU72P53538 206 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M LSM7P53905 115 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M OCA2P53949 197 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M LRS4Q04087 347 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M FMP42Q04991 504 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M POS5Q06892 414 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M YOL029CQ08187 201 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M NGL1Q08213 363 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M USV1Q12132 391 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M ATG31Q12421 196 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M TPI1P00942 248 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M CYC3P06182 269 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M QCR2P07257 368 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data1.99□□□□□ -2.09not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M SIP1P32578 815 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M AVT5P38176 459 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M RRT1P38192 103 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M CDS1P38221 457 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M RRF1P38771 230 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M WSS1P38838 269 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M ALG13P53178 202 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M YGR050CP53231 118 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M YLR224WQ05947 369 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M YNG1Q08465 219 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M YOR352WQ08816 343 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M YOR385WQ08909 290 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M POC4Q12245 148 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M YGL258W-AQ3E740 77 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M SEC22P22214 214 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M YCR016WP25617 290 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M TIP1P27654 210 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M PPQ1P32945 549 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M UTP11P34247 250 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M SRL3P36167 246 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M IES5P40060 125 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M YNL194CP40169 301 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M YIR035CP40579 254 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M TDA4P47153 279 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M MIC26P50087 233 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M ARO8P53090 500 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M LST7P53237 242 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M PRM7Q12459 698 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M YMR316C-AI2HB70 103 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M SPS2P08459 502 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)MtW(CCA)M FCY2P17064 533 aa1.97□□□□□ -2.09
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