RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K THI74Q04083 370 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K SCW10Q04951 389 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K PEX10Q05568 337 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K SYM1Q06563 197 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K RXT3Q07458 294 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K PAM18Q07914 168 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K RKI1Q12189 258 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K YBR255C-AQ3E776 120 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K BOL1Q3E793 110 aa2.02□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K COX2P00410 251 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K GPM1P00950 247 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K MRS3P10566 314 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K CAP2P13517 287 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K UTR5P32630 166 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K SEC66P33754 206 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K SDH4P37298 181 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K LAG1P38703 411 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K IPI1P38803 334 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K MPC2P38857 129 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K YAR068WP39564 161 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K IRC24P40580 263 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K YGR210CP42942 411 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K AGX1P43567 385 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K YGR219WP53307 113 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K NCE103P53615 221 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K YDR274CP87283 123 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K VPS28Q02767 242 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K SPO19Q03029 223 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K EST3Q03096 181 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K RCF1Q03713 159 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K TRI1Q05024 226 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K RRG8Q06109 277 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K MCM21Q06675 368 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K YPR013CQ12145 317 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K PAA1Q12447 191 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K AGC1Q12482 902 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR011W-AQ3E807 68 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K TAR1Q8TGM6 124 aa2.01□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K CYC1P00044 109 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K CPR4P25334 318 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K ALK2P32789 676 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K MBA1P38300 278 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K ERV15P38312 142 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K MIC12P38341 106 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K DOG2P38773 246 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K DOG1P38774 246 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K NSA2P40078 261 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K CAF16P43569 289 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K YPI1P43587 155 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K ERG25P53045 309 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K YGR025WP53216 100 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K GTF1P53260 183 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K SSU72P53538 206 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K LSM7P53905 115 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K OCA2P53949 197 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K LRS4Q04087 347 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K FMP42Q04991 504 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K POS5Q06892 414 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K YOL029CQ08187 201 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K NGL1Q08213 363 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K USV1Q12132 391 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K ATG31Q12421 196 aa2□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K TPI1P00942 248 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K CYC3P06182 269 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K QCR2P07257 368 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data1.99□□□□□ -2.09not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K SIP1P32578 815 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K AVT5P38176 459 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K RRT1P38192 103 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K CDS1P38221 457 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K RRF1P38771 230 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K WSS1P38838 269 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K ALG13P53178 202 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K YGR050CP53231 118 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K YLR224WQ05947 369 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K YNG1Q08465 219 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR352WQ08816 343 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR385WQ08909 290 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K POC4Q12245 148 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K YGL258W-AQ3E740 77 aa1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K SEC22P22214 214 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K YCR016WP25617 290 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K TIP1P27654 210 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K PPQ1P32945 549 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K UTP11P34247 250 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K SRL3P36167 246 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K IES5P40060 125 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K YNL194CP40169 301 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K YIR035CP40579 254 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K TDA4P47153 279 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K MIC26P50087 233 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K ARO8P53090 500 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K LST7P53237 242 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K PRM7Q12459 698 aa1.98□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR316C-AI2HB70 103 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K SPS2P08459 502 aa1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
tW(CCA)KtW(CCA)K FCY2P17064 533 aa1.97□□□□□ -2.09
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