RNA–Protein interactions for RNA: YLR048W

RPS0B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS0B, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS0B	YLR048W	CYC2	P38909	366 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	TTI2	P47168	421 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	AIF1	P52923	378 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	YER134C	P40081	178 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	YDR274C	P87283	123 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	THI74	Q04083	370 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	DAS2	Q12084	232 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	CSH1	P38287	376 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	FCY21	P40039	528 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	APQ12	P40532	138 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	CAB4	P53332	305 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	RAV2	Q03956	351 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	ODC2	Q99297	307 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	YOR1	P53049	1477 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	YFL019C	P43576	117 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	HHT1	P61830	136 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	NAT3	Q06504	195 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	SCM4	P32564	187 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	UMP1	P38293	148 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	YER084W	P40057	128 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	PGD1	P40356	397 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	YGR201C	P42936	225 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	ORM1	P53224	222 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	FEX1	Q08913	375 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	FEX2	Q08991	375 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	SNC2	P33328	115 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	3.35	□□□□□ -1.87	not detected
RPS0B	YLR048W	DLS1	P40366	167 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	VPS71	Q03433	280 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	NEJ1	Q06148	342 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	YIL177C	P40434	1758 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	YJL225C	P40889	1758 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	SFK1	P35735	353 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	YBR285W	P38354	144 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	YHR180W	P38868	163 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS0B	YLR048W	TAF2	P23255	1407 aa		3.34	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	STP22	P25604	385 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	YHL026C	P38740	315 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	AGE2	P40529	298 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	YJR015W	P47090	510 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	TIM13	P53299	105 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	KRE1	P17260	313 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	AGA2	P32781	87 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	DOC1	P53068	250 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	EAF6	P47128	113 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	YGR219W	P53307	113 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	MRPS8	Q03799	155 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	CSN9	Q03981	162 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	YMR320W	Q04897	101 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	YOR214C	Q12282	236 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	CPR5	P35176	225 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	CCC1	P47818	322 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	ATO3	Q12359	275 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	TIR1	P10863	254 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	YET1	P35723	206 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.29	□□□□□ -1.88	not detected
RPS0B	YLR048W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	YPR195C	Q06594	109 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	FYV12	Q08559	129 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	CCH1	P50077	2039 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	ATP5	P09457	212 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	FMT1	P32785	401 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	YPL073C	P40323	161 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	SBH1	P52870	82 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	MPC3	P53311	146 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	YMR295C	Q03559	197 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	GAL83	Q04739	417 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	RIB3	Q99258	208 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPS0B	YLR048W	MIG1	P27705	504 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RPS0B	YLR048W	SPC25	P40014	221 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RPS0B	YLR048W	PHB1	P40961	287 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RPS0B	YLR048W	CUP9	P41817	306 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RPS0B	YLR048W	YFR054C	P43622	192 aa		3.27	□□□□□ -1.89

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