RNA–Protein interactions for RNA: YJL104W

PAM16, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM16, Length 450 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM16	YJL104W	DSL1	P53847	754 aa		0.65	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	CTF19	Q02732	369 aa		0.65	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	AIM36	Q03798	255 aa		0.65	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	CAB5	Q03941	241 aa		0.65	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	RAV2	Q03956	351 aa		0.65	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YFH1	Q07540	174 aa		0.65	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	LDS2	Q08218	356 aa		0.65	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	APC9	Q12107	265 aa		0.65	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	0.65	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		0.65	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		0.65	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	TIR1	P10863	254 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	CAP2	P13517	287 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YCR101C	P25607	182 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.64	□□□□□ -2.31	not detected
PAM16	YJL104W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	SUA5	P32579	426 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	CPR5	P35176	225 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	AST1	P35183	429 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YKL063C	P35725	167 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	RCN1	P36054	211 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	MRPL17	P36528	281 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	RRT1	P38192	103 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	SHE1	P38200	338 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YBR013C	P38215	129 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	WSS1	P38838	269 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	IPT1	P38954	527 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	SNF11	P38956	169 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	BDH1	P39714	382 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	PCL7	P40186	285 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YIR035C	P40579	254 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	IRC18	P47056	224 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YGL235W	P53071	178 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YGL159W	P53110	370 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	RRN9	P53437	365 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	OCA2	P53949	197 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	COG5	P53951	403 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	GRX3	Q03835	250 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YMR130W	Q04223	302 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	FIT1	Q04433	528 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	PEX30	Q06169	523 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	RRT7	Q07829	113 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YPL264C	Q08980	353 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YDR029W	Q12111	104 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	NSL1	Q12143	216 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	SCM3	Q12334	223 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	DGK1	Q12382	290 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YDL199C	Q12407	687 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	TFC7	Q12415	435 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	KTI11	Q3E840	82 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.64	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	Q0255	P03881	472 aa		0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	PET54	P10834	293 aa		0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	CCA1	P21269	546 aa		0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	ATP7	P30902	174 aa		0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	RPN12	P32496	274 aa		0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YBR285W	P38354	144 aa		0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	DOG2	P38773	246 aa		0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	DOG1	P38774	246 aa		0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	IKI1	P38874	309 aa		0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	ALP1	P38971	573 aa		0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	FCY21	P40039	528 aa		0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	AIM19	P40502	157 aa		0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	OTU1	P43558	301 aa		0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YJL144W	P47009	104 aa		0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YGL149W	P53116	101 aa		0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YGR016W	P53209	190 aa		0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YIP3	P53633	176 aa		0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	UBC7	Q02159	165 aa		0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	MRPS8	Q03799	155 aa		0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	TVP15	Q03860	143 aa		0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	GGA1	Q06336	557 aa		0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	HRD1	Q08109	551 aa		0.63	□□□□□ -2.31
PAM16	YJL104W	VIK1	Q12045	647 aa		0.63	□□□□□ -2.31

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