RNA–Protein interactions for RNA: YBR163W

EXO5, Transcript of Mitochondrial 5'-3' exonuclease and sliding exonuclease, yeast

Gene EXO5, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO5	YBR163W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	MRPL3	P36516	390 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	YGR210C	P42942	411 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	THI74	Q04083	370 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	SCP1	Q08873	200 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	MED4	Q12343	284 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	TFC7	Q12415	435 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	TRA1	P38811	3744 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	APA2	P22108	325 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	POP2	P39008	433 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	PCL7	P40186	285 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	GIM3	P53900	129 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	CAB5	Q03941	241 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	FCY1	Q12178	158 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	SCM3	Q12334	223 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	ARG80	P07249	177 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	MRP17	P28778	131 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	ERG2	P32352	222 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	IES6	P32617	166 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	TTI2	P47168	421 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	CRH1	P53301	507 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	MRPS16	Q02608	121 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	YDR286C	Q05530	114 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	YFH1	Q07540	174 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	YOR292C	Q08743	309 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	AEP3	Q12089	606 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	BBP1	Q12365	385 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	DGK1	Q12382	290 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	SPO24	Q3E752	67 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	YOS1	Q3E834	85 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	AGA1	P32323	725 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	YBR144C	P34215	104 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	YUH1	P35127	236 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	CPR5	P35176	225 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	GPI18	P38211	433 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.72	□□□□□ -1.97	not detected
EXO5	YBR163W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	RPR2	P40571	144 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	YJL213W	P40896	331 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	YDL186W	P48568	277 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	NIF3	P53081	288 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	YGL114W	P53134	725 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	MEH1	Q02205	184 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	VPS28	Q02767	242 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	RRT7	Q07829	113 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	ATO3	Q12359	275 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	PRM4	Q12498	284 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	GCN3	P14741	305 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	ROX3	P25046	220 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	LSB5	P25369	354 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	RRF1	P38771	230 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	IKI1	P38874	309 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	BMT5	P40493	336 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	YIR035C	P40579	254 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	ECM18	Q04623	453 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	ATG5	Q12380	294 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EXO5	YBR163W	QCR2	P07257	368 aa		2.71	□□□□□ -1.98
EXO5	YBR163W	PUT1	P09368	476 aa		2.71	□□□□□ -1.98
EXO5	YBR163W	SEC22	P22214	214 aa		2.71	□□□□□ -1.98
EXO5	YBR163W	RPB9	P27999	122 aa		2.71	□□□□□ -1.98
EXO5	YBR163W	SUA5	P32579	426 aa		2.71	□□□□□ -1.98
EXO5	YBR163W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
EXO5	YBR163W	RFC2	P40348	353 aa		2.71	□□□□□ -1.98
EXO5	YBR163W	YJR012C	P47087	207 aa		2.71	□□□□□ -1.98
EXO5	YBR163W	LPP1	Q04396	274 aa		2.71	□□□□□ -1.98
EXO5	YBR163W	AYT1	Q12226	474 aa		2.71	□□□□□ -1.98
EXO5	YBR163W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
EXO5	YBR163W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
EXO5	YBR163W	ACB1	P31787	87 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EXO5	YBR163W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
EXO5	YBR163W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
EXO5	YBR163W	PMU1	P36069	295 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EXO5	YBR163W	PRM5	P40476	318 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EXO5	YBR163W	YJR056C	P47115	236 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EXO5	YBR163W	ABM1	P47146	123 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EXO5	YBR163W	MIX17	Q03667	156 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EXO5	YBR163W	PLP1	Q04004	230 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EXO5	YBR163W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98

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