RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492265.1

GRB10-223, Transcript of growth factor receptor bound protein 10, human

TSL 3

Gene GRB10, Length 447 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRB10-223	ENST00000492265	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRB10-223	ENST00000492265	EHD2	Q9NZN4	543 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRB10-223	ENST00000492265	CNTN3	Q9P232	1028 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRB10-223	ENST00000492265	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GRB10-223	ENST00000492265	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRB10-223	ENST00000492265	DERA	Q9Y315	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRB10-223	ENST00000492265	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRB10-223	ENST00000492265	SCN1A	P35498	2009 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRB10-223	ENST00000492265	PATJ	Q8NI35	1801 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	LACTBL1	A8MY62	500 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	KCNK3	O14649	394 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	ERLIN2	O94905	339 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	CLSTN1	O94985	981 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	GNRH1	P01148	92 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	GLI1	P08151	1106 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	MYL3	P08590	195 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	MYBL2	P10244	700 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	GNAT1	P11488	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	ABCB4	P21439	1286 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	FGFR4	P22455	802 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	GNA15	P30679	374 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	ATIC	P31939	592 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	APLP1	P51693	650 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	BPIFB4	P59827	614 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	MYL6	P60660	151 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	GPC5	P78333	572 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	SP3	Q02447	781 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	INCA1	Q0VD86	236 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	PTP4A2	Q12974	167 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	TRIM32	Q13049	653 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	BIRC3	Q13489	604 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	CASP8	Q14790	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	WDR44	Q5JSH3	913 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	UBXN11	Q5T124	520 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	C8orf74	Q6P047	294 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	NOTUM	Q6P988	496 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	PEX26	Q7Z412	305 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	SERINC5	Q86VE9	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	CD302	Q8IX05	232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	PLPP6	Q8IY26	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	WHAMM	Q8TF30	809 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	CD101	Q93033	1021 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	WNT8B	Q93098	351 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	OSMR	Q99650	979 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	TCHP	Q9BT92	498 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	CARD9	Q9H257	536 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62	3e-6	■■■■■ 79.6
GRB10-223	ENST00000492265	CISH	Q9NSE2	258 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	RNF186	Q9NXI6	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	STIM2	Q9P246	746 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	SRRD	Q9UH36	339 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	ALG6	Q9Y672	507 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	GRIN2D	O15399	1336 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GRB10-223	ENST00000492265	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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