RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 NSFP46459 744 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CENPCQ03188 943 aa11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ITIH3Q06033 890 aa11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNA10Q16322 511 aa11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 LRRC26Q2I0M4 334 aa11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 NAA35Q5VZE5 725 aa11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 NT5DC3Q86UY8 548 aa11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 SERINC5Q86VE9 423 aa11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 C7orf61Q8IZ16 206 aa11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 HPDLQ96IR7 371 aa11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 PBKQ96KB5 322 aa11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 TSPAN18Q96SJ8 248 aa11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 PSMB7Q99436 277 aa11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CYP3A43Q9HB55 503 aa11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ABCB6Q9NP58 842 aa11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 UVRAGQ9P2Y5 699 aa11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 AMFRQ9UKV5 643 aa11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 COG5Q9UP83 839 aa11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 AGAP1Q9UPQ3 857 aa11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CDY2AQ9Y6F7 541 aa11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM170AA1A519 330 aa11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CABYRO75952 493 aa11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 RECQL4O94761 1208 aa11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 LSM8O95777 96 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 WEE2P0C1S8 567 aa11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CXCR5P32302 372 aa11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 DNA2P51530 1060 aa11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 GUCY2FP51841 1108 aa11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 NOMO3P69849 1222 aa11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 RBM10P98175 930 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 MYO1EQ12965 1108 aa11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 WDR72Q3MJ13 1102 aa11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CFAP221Q4G0U5 840 aa11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 UBXN11Q5T124 520 aa11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 LIN9Q5TKA1 542 aa11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 RNF180Q86T96 592 aa11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 RPAINQ86UA6 219 aa11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM228AQ86W67 206 aa11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 MCOLN2Q8IZK6 566 aa11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 TTC39CQ8N584 583 aa11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 BEST2Q8NFU1 509 aa11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 NUP85Q9BW27 656 aa11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 GOLPH3Q9H4A6 298 aa11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 SMYD3Q9H7B4 428 aa11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CNTN3Q9P232 1028 aa11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNK3O14649 394 aa11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 MED7O43513 233 aa11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 XPOTO43592 962 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 PAEPP09466 180 aa11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 BRD2P25440 801 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 RAP1GAPP47736 663 aa11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 TNNC1P63316 161 aa11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC70Q6NSX1 233 aa11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ALKAL1Q6UXT8 129 aa11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 MON1BQ7L1V2 547 aa11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 PASD1Q8IV76 773 aa11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 PDCL2Q8N4E4 241 aa11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 LRRC52Q8N7C0 313 aa11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 MSANTD4Q8NCY6 345 aa11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF606Q8WXB4 792 aa11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CPA5Q8WXQ8 436 aa11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CYFIP2Q96F07 1278 aa11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 HES6Q96HZ4 224 aa11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 VCPIP1Q96JH7 1222 aa11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 SELENOOQ9BVL4 669 aa11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 APOL6Q9BWW8 343 aa11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 SDCBP2Q9H190 292 aa11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 PCDHGC3Q9UN70 934 aa11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 HES2Q9Y543 173 aa11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 NR2E3Q9Y5X4 410 aa11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa11.05□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 COL6A3P12111 3177 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 TLR3O15455 904 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CILPO75339 1184 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 RPS6KA5O75582 802 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CD4P01730 458 aa11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms