RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 SAR1AQ9NR31 198 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 DKK3Q9UBP4 350 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 A0A087X0T9 212 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 FAM228BP0C875 321 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 GJA8P48165 433 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 ARMCX4Q5H9R4 360 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 TMC3Q7Z5M5 1100 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 TRIM69Q86WT6 500 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 EPS8L2Q9H6S3 715 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 COPG2Q9UBF2 871 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 ZNF804BA4D1E1 1349 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 AP3B1O00203 1094 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 TSC22D2O75157 780 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 MTERF2Q49AM1 385 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 MTERF3Q96E29 417 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 ZSWIM1Q9BR11 485 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 MAGEB5Q9BZ81 275 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 WDR17Q8IZU2 1322 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 ABLIM1O14639 778 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 CD44P16070 742 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 FMO5P49326 533 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 MTTPP55157 894 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 OSTNP61366 133 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 SYDE2Q5VT97 1194 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 GRIP2Q9C0E4 1043 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 TASP1Q9H6P5 420 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 EURLQ9NYK6 297 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 HSPBP1Q9NZL4 362 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 GRK2P25098 689 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 PPIL6Q8IXY8 311 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 CENPTQ96BT3 561 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 FAM213AQ9BRX8 229 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 MBD5Q9P267 1494 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 MYO1GB0I1T2 1018 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 RGS5O15539 181 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 TBC1D12O60347 775 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 SOX6P35712 828 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 GRM4Q14833 912 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 CDH24Q86UP0 819 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 NCAPG2Q86XI2 1143 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 SPICE1Q8N0Z3 855 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 CNKSR1Q969H4 720 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 NAGPAQ9UK23 515 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 PCDHA6Q9UN73 950 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 MYRFQ9Y2G1 1151 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 KDM6BO15054 1643 aa16.77■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 TRIM24O15164 1050 aa16.77■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 CBX6O95503 412 aa16.77■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 PRELPP51888 382 aa16.77■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 CCDC142Q17RM4 750 aa16.77■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa16.77■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 MAD2L2Q9UI95 211 aa16.77■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 PDIA5Q14554 519 aa16.77■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 EDRF1Q3B7T1 1238 aa16.77■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 LRRC39Q96DD0 335 aa16.77■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 SEMA4AQ9H3S1 761 aa16.77■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 BMP3P12645 472 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 SOX11P35716 441 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 KCNJ2P63252 427 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 GSTA3Q16772 222 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 PLGRKTQ9HBL7 147 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 HPSEQ9Y251 543 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 CBFA2T3O75081 653 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 TSPAN9O75954 239 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 PPP1R18Q6NYC8 613 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 CD302Q8IX05 232 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 IL1RL2Q9HB29 575 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 H7C1W4 665 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 SLC16A4O15374 487 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 TDP2O95551 362 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 ATP6V1E1P36543 226 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 KCNQ4P56696 695 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 C6orf10Q5SRN2 563 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 PGM2Q96G03 612 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 TMEM47Q9BQJ4 181 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 IL25Q9H293 177 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 PALLDQ8WX93 1383 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 ATP9BO43861 1147 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 ZNF23P17027 643 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 SERPINB5P36952 375 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 CDK8P49336 464 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 RBBP7Q16576 425 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 ANO4Q32M45 955 aa16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms