RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 DNAJB3Q8WWF6 145 aa25.48■■□□□ 1.67
RPUSD1-201ENST00000007264 ESYT3A0FGR9 886 aa25.48■■□□□ 1.67
RPUSD1-201ENST00000007264 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
RPUSD1-201ENST00000007264 CD19P15391 556 aa25.48■■□□□ 1.67
RPUSD1-201ENST00000007264 LLGL2Q6P1M3 1020 aa25.48■■□□□ 1.67
RPUSD1-201ENST00000007264 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP25.48■■□□□ 1.67
RPUSD1-201ENST00000007264 KIF12Q96FN5 646 aa25.48■■□□□ 1.67
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa25.48■■□□□ 1.67
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RPUSD1-201ENST00000007264 PARVAQ9NVD7 372 aa25.48■■□□□ 1.67
RPUSD1-201ENST00000007264 DPP3Q9NY33 737 aa25.48■■□□□ 1.67
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RPUSD1-201ENST00000007264 AMACRQ9UHK6 382 aa25.47■■□□□ 1.67
RPUSD1-201ENST00000007264 C17orf102A2RUQ5 167 aa25.46■■□□□ 1.67
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RPUSD1-201ENST00000007264 NFU1Q9UMS0 254 aa25.46■■□□□ 1.67
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RPUSD1-201ENST00000007264 C7orf31Q8N865 590 aa25.46■■□□□ 1.67
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RPUSD1-201ENST00000007264 SMYD3Q9H7B4 428 aa25.46■■□□□ 1.67
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RPUSD1-201ENST00000007264 PYGMP11217 842 aa25.45■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 ADAM17P78536 824 aa25.45■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 PTP4A2Q12974 167 aa25.45■■□□□ 1.66
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RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
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RPUSD1-201ENST00000007264 TTI1O43156 1089 aa25.42■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 PSMC4P43686 418 aa25.42■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 SNX17Q15036 470 aa25.42■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 DNAJC24Q6P3W2 148 aa25.42■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 ERVK-5Q9HDB9 667 aa25.42■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 KPNA6O60684 536 aa25.41■■□□□ 1.66
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