RNA–Protein interactions for RNA: YPR137W

RRP9, Transcript of Protein involved in pre-rRNA processing, yeast

Gene RRP9, Length 1,722 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP9	YPR137W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP9	YPR137W	CKA1	P15790	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP9	YPR137W	YMR31	P19955	123 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP9	YPR137W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRP9	YPR137W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRP9	YPR137W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRP9	YPR137W	YFH1	Q07540	174 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP9	YPR137W	GEP3	Q08622	556 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP9	YPR137W	SOG2	Q08817	791 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP9	YPR137W	INP53	Q12271	1107 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP9	YPR137W	SEN2	P16658	377 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	MRS4	P23500	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	GEP4	P38812	185 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	COX15	P40086	486 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	RFC2	P40348	353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	ATG18	P43601	500 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	MSC3	Q05812	728 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	COX2	P00410	251 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	ERV1	P27882	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	HMX1	P32339	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	GET2	P40056	285 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	ECM27	P47144	725 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	UBP8	P50102	471 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	ERG25	P53045	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	CAB5	Q03941	241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	BOL1	Q3E793	110 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	HYM1	P32464	399 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	MED4	Q12343	284 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	CDC23	P16522	626 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	MED8	P38304	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	YML018C	Q03730	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	SCW10	Q04951	389 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	UBA3	Q99344	299 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	FMP23	P38231	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	YJR012C	P47087	207 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	CGR1	P53188	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	KEI1	Q06346	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	YLR031W	Q07978	186 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	HRD1	Q08109	551 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	RKI1	Q12189	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	VPS63	O13549	108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	YPS1	P32329	569 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	SEC66	P33754	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	YNL194C	P40169	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	CRH1	P53301	507 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	YGR219W	P53307	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	EOS1	P53938	366 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	YDR274C	P87283	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	MGR3	Q04472	501 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	GPX2	P38143	162 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	MPC2	P38857	129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	CAT5	P41735	233 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	TDA6	Q06466	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	IRC23	Q08416	157 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	RNP1	P32385	249 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	FMT1	P32785	401 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	YJR096W	P47137	282 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	MIC12	P38341	106 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	LST8	P41318	303 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	MSE1	P48525	536 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	CPD1	P53314	239 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	ERV29	P53337	310 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	VBA1	Q04301	562 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	YNG1	Q08465	219 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	PET20	Q99373	253 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RRP9	YPR137W	PDC2	P32896	925 aa		4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 83.5 ms