RNA–Protein interactions for RNA: YMR068W

AVO2, Transcript of Component of a complex containing the Tor2p kinase and other proteins, yeast

Gene AVO2, Length 1,281 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AVO2	YMR068W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
AVO2	YMR068W	VHT1	P53241	593 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AVO2	YMR068W	OST6	Q03723	332 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AVO2	YMR068W	PAM18	Q07914	168 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AVO2	YMR068W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
AVO2	YMR068W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AVO2	YMR068W	IFM1	P25038	676 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVO2	YMR068W	MRPL6	P32904	214 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVO2	YMR068W	YDR114C	Q04597	100 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVO2	YMR068W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVO2	YMR068W	MIM1	Q08176	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVO2	YMR068W	HRT1	Q08273	121 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AVO2	YMR068W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AVO2	YMR068W	DOA4	P32571	926 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	YBR096W	P38256	230 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	VPH2	P32341	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	YOX1	P34161	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	PET8	P38921	284 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	MIG3	P39943	394 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	YGL235W	P53071	178 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	YNR062C	P53748	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	RNH201	P53942	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	YPR127W	Q06494	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	SIR2	P06700	562 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	CDC50	P25656	391 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	JEN1	P36035	616 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	SHE1	P38200	338 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	MSS2	P40990	351 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	OTU1	P43558	301 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	YDC1	Q02896	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	TVP15	Q03860	143 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	ZRC1	P20107	442 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	MRPS28	P21771	286 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	POF1	P25576	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	SDS24	P38314	527 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	YPI1	P43587	155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	KRE28	Q04431	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	PEX30	Q06169	523 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	MSH5	Q12175	901 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	SAS5	Q99314	248 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	SPG4	Q04438	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	DPP1	Q05521	289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	LIP2	Q06005	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	SPO77	Q06134	477 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	SFH1	Q06168	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	CTR3	Q06686	241 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	MRPL17	P36528	281 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	STB1	P42845	420 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	CGR1	P53188	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	GET1	P53192	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	YNR066C	P53752	436 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	ADD37	Q03233	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	VIK1	Q12045	647 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AVO2	YMR068W	AIM29	P36154	155 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	RMD6	P39975	231 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	NUP57	P48837	541 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	SDS23	P53172	527 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	COX5B	P00425	151 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	IGD1	P43598	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	HIT1	P46973	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	YJR012C	P47087	207 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	TPN1	P53099	579 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	BNA7	Q04066	261 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	YDR115W	Q04598	105 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	GTO3	Q04806	366 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	ARG80	P07249	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	SGA1	P08019	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	SWD3	P38123	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	GON7	P46984	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	RSM27	P53305	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	YML018C	Q03730	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	CSM4	Q08955	156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	YER184C	P39961	794 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
AVO2	YMR068W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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