RNA–Protein interactions for RNA: YMR007W

YMR007W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YMR007W, Length 381 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR007WYMR007W VHT1P53241 593 aa6.42□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W CWC25P53854 179 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W YLR281CQ05863 155 aa6.42□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W YLR365WQ7LIF2 110 aa6.42□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W CHO1P08456 276 aa6.41□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W SEC66P33754 206 aa6.41□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W PCL6P40038 420 aa6.41□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W WWM1P43582 211 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W SRB7P47822 140 aa6.41□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W RBL2P48606 106 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W ALG9P53868 555 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W RCF1Q03713 159 aa6.41□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W YDR179W-AQ03983 463 aa6.41□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W YFH1Q07540 174 aa6.41□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W YOR292CQ08743 309 aa6.41□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W URA3P03962 267 aa6.4□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W AAC1P04710 309 aa6.4□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W CKA1P15790 372 aa6.4□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W HYM1P32464 399 aa6.4□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W MSS1P32559 526 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W RIB7P33312 244 aa6.4□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W SDH4P37298 181 aa6.4□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W GEP4P38812 185 aa6.4□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W YIL060WP40519 144 aa6.4□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W YJL218WP40892 196 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W ERG25P53045 309 aa6.4□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W YHP1Q04116 353 aa6.4□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W AEP3Q12089 606 aa6.4□□□□□ -1.38
YMR007WYMR007W GOS1P38736 223 aa6.39□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W GET2P40056 285 aa6.39□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W ECM27P47144 725 aa6.39□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W TSA2Q04120 196 aa6.39□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W YDR215CQ12240 137 aa6.39□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W Q0142Q9ZZW4 58 aa6.39□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W GPM1P00950 247 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W YMR31P19955 123 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W ROX3P25046 220 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data6.38□□□□□ -1.39not detected
YMR007WYMR007W FMP23P38231 175 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W COX15P40086 486 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W ATG18P43601 500 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W YJL163CP46996 555 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W YJR012CP47087 207 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W YGR042WP53227 271 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W GIM3P53900 129 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W ACT1P60010 375 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W MSC3Q05812 728 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W GEP3Q08622 556 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W ATG41Q12048 136 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W MED4Q12343 284 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W YPR108W-AQ3E7B3 70 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W HTB1P02293 131 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W STF2P16965 84 aa6.37□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W MDM10P18409 493 aa6.37□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W RPL24BP24000 155 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W VMA8P32610 256 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W MRPL22P53881 309 aa6.37□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W MEH1Q02205 184 aa6.37□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W YML122CQ03207 126 aa6.37□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W GRH1Q04410 372 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W ASM4Q05166 528 aa6.37□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W ERV1P27882 189 aa6.36□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W AGA2P32781 87 aa6.36□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W MED8P38304 223 aa6.36□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W GVP36P40531 326 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W OTU1P43558 301 aa6.36□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W RPA34P47006 233 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W IMD3P50095 523 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W CAB5Q03941 241 aa6.36□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W HRD1Q08109 551 aa6.36□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W YNG1Q08465 219 aa6.36□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W UBA3Q99344 299 aa6.36□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W HOM6P31116 359 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W TMA20P89886 181 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W YML018CQ03730 393 aa6.35□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W TDA6Q06466 467 aa6.35□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W RKI1Q12189 258 aa6.35□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W SUS1Q6WNK7 96 aa6.35□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W SEN2P16658 377 aa6.34□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W YKR045CP36138 183 aa6.34□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W UBP8P50102 471 aa6.34□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W MRPL35Q06678 367 aa6.34□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W PBP4Q07362 185 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W YLR031WQ07978 186 aa6.34□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W INP53Q12271 1107 aa6.34□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W YJR112W-AQ3E743 109 aa6.34□□□□□ -1.39
YMR007WYMR007W CDC23P16522 626 aa6.33□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W MPC2P38857 129 aa6.33□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W YNL194CP40169 301 aa6.33□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W SYG1P40528 902 aa6.33□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W NGL1Q08213 363 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W BOL1Q3E793 110 aa6.33□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W HUG1Q6Q5K6 68 aa6.33□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W VPS63O13549 108 aa6.32□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W TRR1P29509 319 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
YMR007WYMR007W RNP1P32385 249 aa6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 121.4 ms