RNA–Protein interactions for RNA: YKR082W

NUP133, Transcript of Subunit of Nup84p subcomplex of nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene NUP133, Length 3,474 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUP133	YKR082W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YIL060W	P40519	144 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	UBC13	P52490	153 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YPR114W	Q06107	315 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SPC3	Q12133	184 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	KAR4	P25583	335 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	CDC5	P32562	705 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	ZRT1	P32804	376 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	NNK1	P36003	928 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	PMU1	P36069	295 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	RPB11	P38902	120 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SNO3	P43544	222 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	RRT5	P43607	289 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	EAF6	P47128	113 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SNO2	P53823	222 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	WSC2	P53832	503 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	HPF1	Q05164	967 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	LOA1	Q06508	300 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	TAZ1	Q06510	381 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YDL242W	Q07746	117 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	MCP1	Q12106	302 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	FUN14	P18411	198 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SPO13	P23624	291 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	CDC20	P26309	610 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	MET22	P32179	357 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YGL015C	P33199	130 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	GET2	P40056	285 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YER189W	P40104	122 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YIL059C	P40520	121 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SCS3	P53012	380 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	VPS71	Q03433	280 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YPR098C	Q06089	161 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	MCH4	Q08268	501 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	HEM2	P05373	342 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SIR2	P06700	562 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	PEX34	P25584	144 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	COQ3	P27680	312 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	MST28	P39552	234 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YNL320W	P42840	284 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	CAB4	P53332	305 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SHH4	Q06236	168 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	ASA1	Q06822	443 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	RAD28	Q12021	506 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YLR126C	Q12288	251 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	GSC2	P40989	1895 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	COX1	P00401	534 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SUC2	P00724	532 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	RAS1	P01119	309 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	MRPL9	P31334	269 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	ARN2	P38724	620 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	BXI1	P48558	297 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SHH3	Q04487	196 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	ORT1	Q12375	292 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	MRP10	O75012	95 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	BAR1	P12630	587 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	ATR1	P13090	542 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	MDM10	P18409	493 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	RPB5	P20434	215 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YCR007C	P25354	239 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SSS1	P35179	80 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	KEG1	P43614	200 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SFT1	P43682	97 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	LCB3	P47013	409 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YDL057W	Q07379	328 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YDL180W	Q12301	547 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YLR415C	O13578	112 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YKL102C	P34249	101 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	ATG12	P38316	186 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	MUP1	P50276	574 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	TIM13	P53299	105 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	APJ1	P53940	528 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	TPP1	Q03796	238 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.56	□□□□□ -1.84	not detected
NUP133	YKR082W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	MSI1	P13712	422 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	ETR1	P38071	380 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SDS24	P38314	527 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	YCK3	P39962	524 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SPC25	P40014	221 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	SAY1	P53324	424 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUP133	YKR082W	PGA1	P53896	198 aa		3.56	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.5 ms