RNA–Protein interactions for RNA: YJL075C

APQ13, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene APQ13, Length 417 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APQ13	YJL075C	YOL160W	Q08321	113 aa		0.67	□□□□□ -2.3
APQ13	YJL075C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
APQ13	YJL075C	SIP3	P38717	1229 aa		0.66	□□□□□ -2.3
APQ13	YJL075C	ERG28	P40030	148 aa		0.66	□□□□□ -2.3
APQ13	YJL075C	YNL194C	P40169	301 aa		0.66	□□□□□ -2.3
APQ13	YJL075C	RAD17	P48581	401 aa		0.66	□□□□□ -2.3
APQ13	YJL075C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
APQ13	YJL075C	RCE1	Q03530	315 aa		0.66	□□□□□ -2.3
APQ13	YJL075C	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		0.65	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	TCA17	P32613	152 aa		0.65	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	YBR285W	P38354	144 aa		0.65	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	YHL042W	P38729	150 aa		0.65	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	VMA22	P38784	181 aa		0.65	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	0.65	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	0.65	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	YGR050C	P53231	118 aa		0.65	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	PDR17	P53844	350 aa		0.65	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	0.65	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	YHR007C-A	Q07074	71 aa		0.65	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	JLP1	Q12358	412 aa		0.65	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		0.65	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	YIL177C	P40434	1758 aa		0.65	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	YJL225C	P40889	1758 aa		0.65	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	SEC11	P15367	167 aa		0.64	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	STE18	P18852	110 aa		0.64	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	COQ1	P18900	473 aa		0.64	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	ATP15	P21306	62 aa		0.64	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	CWC27	Q02770	301 aa		0.64	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	YDR249C	Q03787	373 aa		0.64	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		0.63	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	MER1	P16523	270 aa		0.63	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	SPS18	P32572	300 aa		0.63	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	YPL073C	P40323	161 aa		0.63	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	IRC18	P47056	224 aa		0.63	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	MGA1	P53050	456 aa		0.63	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	MDM32	Q12171	622 aa		0.63	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	SEY1	Q99287	776 aa		0.63	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	TRM5	P38793	499 aa		0.61	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	OTU1	P43558	301 aa		0.61	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	AIM25	P47140	327 aa		0.61	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	COG5	P53951	403 aa		0.61	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	ARG80	P07249	177 aa		0.6	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	GET1	P53192	235 aa		0.6	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	0.6	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	GIS3	Q12418	502 aa		0.6	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	SPO13	P23624	291 aa		0.59	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	MPC3	P53311	146 aa		0.59	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	LCL2	Q08045	131 aa		0.59	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	DGA1	Q08650	418 aa		0.59	□□□□□ -2.31
APQ13	YJL075C	MSS2	P40990	351 aa		0.58	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	MDM35	O60200	86 aa		0.57	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	YFH7	P43591	353 aa		0.57	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	YMR252C	Q04814	134 aa		0.57	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	YOL014W	Q08110	124 aa		0.57	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	YNG1	Q08465	219 aa		0.57	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	0.56	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	YCL042W	P25572	119 aa		0.56	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	ECM4	P36156	370 aa		0.56	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	YCR087C-A	P37263	153 aa		0.56	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	IKI1	P38874	309 aa		0.56	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	AIM2	P39721	246 aa		0.56	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	YEA4	P40004	342 aa		0.56	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	NCB2	Q92317	146 aa		0.56	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	CBF1	P17106	351 aa		0.55	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	TAF14	P35189	244 aa		0.55	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	0.55	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	YEL008W	P40001	126 aa		0.55	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	IRC23	Q08416	157 aa		0.55	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	FIT2	Q08906	153 aa		0.55	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	YPR013C	Q12145	317 aa		0.55	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	ODC2	Q99297	307 aa		0.55	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	HTB2	P02294	131 aa		0.54	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32

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