RNA–Protein interactions for RNA: YJL036W

SNX4, Transcript of Sorting nexin, yeastyeast

Gene SNX4, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNX4YJL036W RPB3P16370 318 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W KRE1P17260 313 aa2.37□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W CCA1P21269 546 aa2.37□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W SCO1P23833 295 aa2.37□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W RSA4P25382 515 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W CLG1P35190 452 aa2.37□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W CTR2P38865 189 aa2.37□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W ICE2P40499 491 aa2.37□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W ARP3P47117 449 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W DSK2P48510 373 aa2.37□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W AIF1P52923 378 aa2.37□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W CAB4P53332 305 aa2.37□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W SHH4Q06236 168 aa2.37□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W YLR031WQ07978 186 aa2.37□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W TSC3Q3E790 80 aa2.37□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W DPM1P14020 267 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W PET9P18239 318 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W ARO7P32178 256 aa2.36□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W FIG1P38224 298 aa2.36□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W MED6P38782 295 aa2.36□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W AIM2P39721 246 aa2.36□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W YGL235WP53071 178 aa2.36□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W YGL088WP53151 121 aa2.36□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W SWP1Q02795 286 aa2.36□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W HNT1Q04344 158 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W DGA1Q08650 418 aa2.36□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W YPR014CQ6B0W2 109 aa2.36□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W AHC2P25649 128 aa2.35□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W MIG1P27705 504 aa2.35□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W YHL026CP38740 315 aa2.35□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W YFH7P43591 353 aa2.35□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W MNN5P46982 586 aa2.35□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W SNX4P47057 423 aa2.35□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W TMA22P47089 198 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W NUP49Q02199 472 aa2.35□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W PLP1Q04004 230 aa2.35□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W MHT1Q12525 324 aa2.35□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W TIM9O74700 87 aa2.34□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W CMD1P06787 147 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W SCM4P32564 187 aa2.34□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W MRPL17P36528 281 aa2.34□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W SKI6P46948 246 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W YJR111CP47148 283 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W HPT1Q04178 221 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
SNX4YJL036W RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W MRPS28P21771 286 aa2.33□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W AVT2P39981 480 aa2.33□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W SBH2P52871 88 aa2.33□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W ARR2Q06597 130 aa2.33□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W YLR053CQ12026 108 aa2.33□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W MPD1Q12404 318 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W PRM7Q12459 698 aa2.33□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W RPL26AP05743 127 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W ATP15P21306 62 aa2.32□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W MEI4P29467 408 aa2.32□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W OCH1P31755 480 aa2.32□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W YKL102CP34249 101 aa2.32□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W TVP38P36164 337 aa2.32□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W OPY1P38271 328 aa2.32□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W DER1P38307 211 aa2.32□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W PGD1P40356 397 aa2.32□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W PRM10P42946 383 aa2.32□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W RPL26BP53221 127 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W PGA1P53896 198 aa2.32□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W SLM2P53955 656 aa2.32□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W YDR274CP87283 123 aa2.32□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W MAK3Q03503 176 aa2.32□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W GPI17Q04080 534 aa2.32□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W NEJ1Q06148 342 aa2.32□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W PET20Q99373 253 aa2.32□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W YPR096CO13587 100 aa2.31□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W FMP23P38231 175 aa2.31□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W YHR180WP38868 163 aa2.31□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W GVP36P40531 326 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W SER2P42941 309 aa2.31□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W DYN3Q04949 312 aa2.31□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W YOL014WQ08110 124 aa2.31□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W YOR342CQ12182 319 aa2.31□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W ATO3Q12359 275 aa2.31□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W YML100W-AQ8TGT0 57 aa2.31□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W PAN3P36102 679 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W EDC3P39998 551 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W CIS3P47001 227 aa2.3□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W YJL144WP47009 104 aa2.3□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W EAF6P47128 113 aa2.3□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W TDA4P47153 279 aa2.3□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W YJR146WP47174 117 aa2.3□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W YGR219WP53307 113 aa2.3□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W RDI1Q12434 202 aa2.3□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W CPA1P07258 411 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W SNC2P33328 115 aa2.29□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W SRP102P36057 244 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W SDH4P37298 181 aa2.29□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W UMP1P38293 148 aa2.29□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W YEA4P40004 342 aa2.29□□□□□ -2.04
SNX4YJL036W SPO73P40031 143 aa2.29□□□□□ -2.04
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