RNA–Protein interactions for RNA: YHR050W

SMF2, Transcript of Divalent metal ion transporter involved in manganese homeostasis, yeast

Gene SMF2, Length 1,650 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMF2	YHR050W	YDC1	Q02896	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	MRP51	Q02950	344 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	GMC1	Q04399	608 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	ATX2	Q12067	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	HUT1	Q12520	339 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	COA6	Q3E846	104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	MET3	P08536	511 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	SPS4	P09937	338 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	FUN14	P18411	198 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	YCR101C	P25607	182 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	PEX4	P29340	183 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	MRPS9	P38120	278 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	PHS1	P40857	217 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	PRY1	P47032	299 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	YGL262W	P53054	175 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	TNA1	P53322	534 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	MRPL19	P53875	158 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	CYT2	Q00873	224 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	VPS28	Q02767	242 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	SEN15	Q04675	128 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	MRP10	O75012	95 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	PAU3	P25610	124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	YBR292C	P38357	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	WSS1	P38838	269 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	XBP1	P40489	647 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	IKS1	P47042	667 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	YNR066C	P53752	436 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	SKO1	Q02100	647 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	COQ11	Q05892	277 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	MRL1	Q06815	381 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	RFU1	Q08003	200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	IZH2	Q12442	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	FMP27	Q06179	2628 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	STE4	P18851	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	OCH1	P31755	480 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	REC114	P32841	428 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	POP2	P39008	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	PIG2	P40187	538 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	HCH1	P53834	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	YAP6	Q03935	383 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	TDA6	Q06466	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	YDL180W	Q12301	547 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	SLM6	P38343	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	YIL169C	P40442	995 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	ATG4	P53867	494 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	TMA17	Q12513	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	ADE8	P04161	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	SAG1	P20840	650 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	SEC62	P21825	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	MNS1	P32906	549 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	RPB7	P34087	171 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	MCH2	P36032	473 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	MRPL39	P36533	70 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	HNT2	P49775	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	FYV7	Q12247	151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	VMA16	P23968	213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	LSB5	P25369	354 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	PAC2	P39937	518 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	YIL029C	P40538	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	YJR012C	P47087	207 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	ATC1	Q04005	294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	YMR082C	Q04276	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	FRE8	Q12209	686 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	MSI1	P13712	422 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	MAK32	P23060	363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMF2	YHR050W	LDB16	P25587	256 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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