RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 GNRH1P01148 92 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 DNA2P51530 1060 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 GUCY2FP51841 1108 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 SERINC5Q86VE9 423 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 SESTD1Q86VW0 696 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 CYFIP2Q96F07 1278 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 BCO2Q9BYV7 579 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 VRTNQ9H8Y1 702 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 CDY2AQ9Y6F7 541 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 KIF4AO95239 1232 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 CYP1A2P05177 515 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 CFHP08603 1231 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 RBP5P82980 135 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 ZNF394Q53GI3 561 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 TRIM72Q6ZMU5 477 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 NT5DC3Q86UY8 548 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 ZNF606Q8WXB4 792 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 CPA5Q8WXQ8 436 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 ZNF653Q96CK0 615 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 HPDLQ96IR7 371 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 EPC1Q9H2F5 836 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 ABCB6Q9NP58 842 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 CENPCQ03188 943 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 PTPROQ16827 1216 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 UBXN11Q5T124 520 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 NAA35Q5VZE5 725 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 FAM228AQ86W67 206 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 WNT8BQ93098 351 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 TRPV2Q9Y5S1 764 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 RECQL4O94761 1208 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 AKAP5P24588 427 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 NSFP46459 744 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 ZBTB6Q15916 424 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 CCDC181Q5TID7 509 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 RNF180Q86T96 592 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 APOL6Q9BWW8 343 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 CNTN3Q9P232 1028 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 RNF14Q9UBS8 474 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 AMFRQ9UKV5 643 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 GRIN2DO15399 1336 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 MTA2O94776 668 aa20.46■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 P4HA1P13674 534 aa20.46■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 PAFAH1B1P43034 410 aa20.46■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 RAP1GAPP47736 663 aa20.46■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 CDH8P55286 799 aa20.46■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 RPAINQ86UA6 219 aa20.46■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 PASD1Q8IV76 773 aa20.46■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 MCOLN2Q8IZK6 566 aa20.46■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 NUP85Q9BW27 656 aa20.46■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 KCNK3O14649 394 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 STAU1O95793 577 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 NOMO3P69849 1222 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 HES6Q96HZ4 224 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 MS4A14Q96JA4 679 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 SDCBP2Q9H190 292 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 SMYD3Q9H7B4 428 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 UVRAGQ9P2Y5 699 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 TRIP11Q15643 1979 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 CES2O00748 559 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 RPS6KA5O75582 802 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 CHRNA1P02708 482 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 CTSHP09668 335 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 MYBL1P10243 752 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 HTRA3P83110 453 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 PTGISQ16647 500 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 C11orf63Q6NUN7 778 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 TRIM11Q96F44 468 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 RNF39Q9H2S5 420 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 CYP3A43Q9HB55 503 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 EHD2Q9NZN4 543 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 BRD2P25440 801 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 ITIH3Q06033 890 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 GLRA4Q5JXX5 417 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 BEST2Q8NFU1 509 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 PBKQ96KB5 322 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms