RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Wscd1Q80XH4 572 aa20.66■□□□□ 0.9
Ltb-201ENSMUST00000025262 Q8C4P0 716 aa20.66■□□□□ 0.9
Ltb-201ENSMUST00000025262 EdaraddQ8VHX2 208 aa20.66■□□□□ 0.9
Ltb-201ENSMUST00000025262 Snx10Q9CWT3 201 aa20.66■□□□□ 0.9
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc32a1O35633 525 aa20.63■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 F9P16294 471 aa20.63■□□□□ 0.89
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Elac2Q80Y81 831 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tspyl4Q8VD63 406 aa20.62■□□□□ 0.89
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc14a1Q8VHL0 384 aa20.62■□□□□ 0.89
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Ltb-201ENSMUST00000025262 MgamB5THE2 1827 aa20.62■□□□□ 0.89
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Tcf3P15806 651 aa20.61■□□□□ 0.89
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Jmjd1cQ69ZK6 2350 aa20.6■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mmrn2A6H6E2 943 aa20.6■□□□□ 0.89
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Serac1Q3U213 654 aa20.6■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rapgef1Q3UHC1 1224 aa20.6■□□□□ 0.89
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Znf423Q80TS5 1292 aa20.6■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mrps27Q8BK72 415 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Enox2Q8R0Z2 598 aa20.6■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rpp40Q8R1F9 363 aa20.6■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Trim29Q8R2Q0 587 aa20.6■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cacnb1Q8R3Z5 597 aa20.6■□□□□ 0.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 PccaQ91ZA3 724 aa20.6■□□□□ 0.89
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