Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41,15■■■■■ 4,18
Mis18aQ9CZJ6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,93■■■■□ 3,66
Mis18aQ9CZJ6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,65
Mis18aQ9CZJ6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,36■■■■□ 3,57
Mis18aQ9CZJ6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,69■■■■□ 3,46
Mis18aQ9CZJ6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,54■■■■□ 3,44
Mis18aQ9CZJ6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,27■■■■□ 3,4
Mis18aQ9CZJ6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,58■■■■□ 3,29
Mis18aQ9CZJ6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35,51■■■■□ 3,28
Mis18aQ9CZJ6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,38■■■■□ 3,25
Mis18aQ9CZJ6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Mis18aQ9CZJ6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Mis18aQ9CZJ6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Mis18aQ9CZJ6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Mis18aQ9CZJ6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,5■■■■□ 3,11
Mis18aQ9CZJ6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Mis18aQ9CZJ6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34,35■■■■□ 3,09
Mis18aQ9CZJ6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Mis18aQ9CZJ6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Mis18aQ9CZJ6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Mis18aQ9CZJ6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Mis18aQ9CZJ6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Mis18aQ9CZJ6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Mis18aQ9CZJ6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Mis18aQ9CZJ6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Mis18aQ9CZJ6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Mis18aQ9CZJ6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Mis18aQ9CZJ6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3,01
Mis18aQ9CZJ6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Mis18aQ9CZJ6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Mis18aQ9CZJ6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,61■■■□□ 2,97
Mis18aQ9CZJ6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Mis18aQ9CZJ6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Mis18aQ9CZJ6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,37■■■□□ 2,93
Mis18aQ9CZJ6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Mis18aQ9CZJ6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,15■■■□□ 2,9
Mis18aQ9CZJ6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Mis18aQ9CZJ6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Mis18aQ9CZJ6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32,89■■■□□ 2,86
Mis18aQ9CZJ6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Mis18aQ9CZJ6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Mis18aQ9CZJ6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Mis18aQ9CZJ6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
Mis18aQ9CZJ6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,55■■■□□ 2,8
Mis18aQ9CZJ6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Mis18aQ9CZJ6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,5■■■□□ 2,79
Mis18aQ9CZJ6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,49■■■□□ 2,79
Mis18aQ9CZJ6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Mis18aQ9CZJ6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32,41■■■□□ 2,78
Mis18aQ9CZJ6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,4■■■□□ 2,78
Mis18aQ9CZJ6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Mis18aQ9CZJ6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32,21■■■□□ 2,75
Mis18aQ9CZJ6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
Mis18aQ9CZJ6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Mis18aQ9CZJ6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Mis18aQ9CZJ6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,14■■■□□ 2,74
Mis18aQ9CZJ6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Mis18aQ9CZJ6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Mis18aQ9CZJ6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Mis18aQ9CZJ6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Mis18aQ9CZJ6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,88■■■□□ 2,69
Mis18aQ9CZJ6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Mis18aQ9CZJ6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Mis18aQ9CZJ6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,79■■■□□ 2,68
Mis18aQ9CZJ6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31,78■■■□□ 2,68
Mis18aQ9CZJ6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Mis18aQ9CZJ6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,69■■■□□ 2,66
Mis18aQ9CZJ6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,68■■■□□ 2,66
Mis18aQ9CZJ6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Mis18aQ9CZJ6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,65■■■□□ 2,66
Mis18aQ9CZJ6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,56■■■□□ 2,64
Mis18aQ9CZJ6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,53■■■□□ 2,64
Mis18aQ9CZJ6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Mis18aQ9CZJ6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Mis18aQ9CZJ6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Mis18aQ9CZJ6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,48■■■□□ 2,63
Mis18aQ9CZJ6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Mis18aQ9CZJ6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Mis18aQ9CZJ6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Mis18aQ9CZJ6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Mis18aQ9CZJ6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Mis18aQ9CZJ6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,35■■■□□ 2,61
Mis18aQ9CZJ6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Mis18aQ9CZJ6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31,33■■■□□ 2,61
Mis18aQ9CZJ6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,6
Mis18aQ9CZJ6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,19■■■□□ 2,58
Mis18aQ9CZJ6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Mis18aQ9CZJ6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Mis18aQ9CZJ6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Mis18aQ9CZJ6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,11■■■□□ 2,57
Mis18aQ9CZJ6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Mis18aQ9CZJ6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Mis18aQ9CZJ6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,56
Mis18aQ9CZJ6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,01■■■□□ 2,55
Mis18aQ9CZJ6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Mis18aQ9CZJ6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Mis18aQ9CZJ6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Mis18aQ9CZJ6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30,87■■■□□ 2,53
Mis18aQ9CZJ6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Mis18aQ9CZJ6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75,7 ms