Protein–RNA interactions for Protein: Q64151

Sema4c, Semaphorin-4C, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4cQ64151 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.57■■■■□ 3.93
Sema4cQ64151 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Sema4cQ64151 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Sema4cQ64151 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Sema4cQ64151 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Sema4cQ64151 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Sema4cQ64151 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Sema4cQ64151 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Sema4cQ64151 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Sema4cQ64151 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Sema4cQ64151 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Sema4cQ64151 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Sema4cQ64151 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Sema4cQ64151 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Sema4cQ64151 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Sema4cQ64151 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Sema4cQ64151 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Sema4cQ64151 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Sema4cQ64151 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Sema4cQ64151 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sema4cQ64151 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sema4cQ64151 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Sema4cQ64151 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Sema4cQ64151 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Sema4cQ64151 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Sema4cQ64151 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Sema4cQ64151 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sema4cQ64151 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Sema4cQ64151 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sema4cQ64151 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Sema4cQ64151 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Sema4cQ64151 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Sema4cQ64151 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sema4cQ64151 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Sema4cQ64151 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sema4cQ64151 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sema4cQ64151 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Sema4cQ64151 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Sema4cQ64151 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sema4cQ64151 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sema4cQ64151 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sema4cQ64151 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sema4cQ64151 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Sema4cQ64151 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sema4cQ64151 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Sema4cQ64151 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Sema4cQ64151 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sema4cQ64151 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sema4cQ64151 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sema4cQ64151 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sema4cQ64151 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Sema4cQ64151 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sema4cQ64151 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sema4cQ64151 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Sema4cQ64151 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sema4cQ64151 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sema4cQ64151 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Sema4cQ64151 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sema4cQ64151 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sema4cQ64151 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Sema4cQ64151 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sema4cQ64151 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sema4cQ64151 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sema4cQ64151 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sema4cQ64151 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sema4cQ64151 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sema4cQ64151 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sema4cQ64151 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sema4cQ64151 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sema4cQ64151 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sema4cQ64151 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sema4cQ64151 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sema4cQ64151 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sema4cQ64151 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sema4cQ64151 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sema4cQ64151 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sema4cQ64151 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sema4cQ64151 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sema4cQ64151 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sema4cQ64151 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sema4cQ64151 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sema4cQ64151 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sema4cQ64151 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sema4cQ64151 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sema4cQ64151 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sema4cQ64151 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sema4cQ64151 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sema4cQ64151 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sema4cQ64151 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Sema4cQ64151 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sema4cQ64151 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sema4cQ64151 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sema4cQ64151 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sema4cQ64151 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sema4cQ64151 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sema4cQ64151 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sema4cQ64151 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sema4cQ64151 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sema4cQ64151 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Sema4cQ64151 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
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