Protein–RNA interactions for Protein: Q61456

Ccna1, Cyclin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna1Q61456 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41,52■■■■■ 4,24
Ccna1Q61456 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,45■■■■□ 3,75
Ccna1Q61456 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38,15■■■■□ 3,7
Ccna1Q61456 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,64■■■■□ 3,62
Ccna1Q61456 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,43■■■■□ 3,58
Ccna1Q61456 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,14■■■■□ 3,54
Ccna1Q61456 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,78■■■■□ 3,48
Ccna1Q61456 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36,09■■■■□ 3,37
Ccna1Q61456 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,85■■■■□ 3,33
Ccna1Q61456 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35,78■■■■□ 3,32
Ccna1Q61456 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,69■■■■□ 3,3
Ccna1Q61456 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Ccna1Q61456 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35,21■■■■□ 3,23
Ccna1Q61456 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Ccna1Q61456 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Ccna1Q61456 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Ccna1Q61456 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34,72■■■■□ 3,15
Ccna1Q61456 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Ccna1Q61456 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Ccna1Q61456 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Ccna1Q61456 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Ccna1Q61456 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Ccna1Q61456 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Ccna1Q61456 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Ccna1Q61456 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Ccna1Q61456 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Ccna1Q61456 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34,32■■■■□ 3,08
Ccna1Q61456 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Ccna1Q61456 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Ccna1Q61456 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Ccna1Q61456 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Ccna1Q61456 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,89■■■■□ 3,02
Ccna1Q61456 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,83■■■■□ 3,01
Ccna1Q61456 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Ccna1Q61456 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,75■■■□□ 2,99
Ccna1Q61456 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Ccna1Q61456 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
Ccna1Q61456 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Ccna1Q61456 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Ccna1Q61456 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Ccna1Q61456 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33,26■■■□□ 2,92
Ccna1Q61456 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Ccna1Q61456 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33,07■■■□□ 2,88
Ccna1Q61456 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,99■■■□□ 2,87
Ccna1Q61456 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Ccna1Q61456 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Ccna1Q61456 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,84■■■□□ 2,85
Ccna1Q61456 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Ccna1Q61456 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Ccna1Q61456 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Ccna1Q61456 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Ccna1Q61456 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Ccna1Q61456 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,67■■■□□ 2,82
Ccna1Q61456 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32,62■■■□□ 2,81
Ccna1Q61456 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Ccna1Q61456 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Ccna1Q61456 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Ccna1Q61456 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32,47■■■□□ 2,79
Ccna1Q61456 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Ccna1Q61456 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,44■■■□□ 2,78
Ccna1Q61456 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Ccna1Q61456 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32,34■■■□□ 2,77
Ccna1Q61456 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Ccna1Q61456 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,28■■■□□ 2,76
Ccna1Q61456 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Ccna1Q61456 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32,24■■■□□ 2,75
Ccna1Q61456 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32,22■■■□□ 2,75
Ccna1Q61456 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32,2■■■□□ 2,75
Ccna1Q61456 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Ccna1Q61456 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,15■■■□□ 2,74
Ccna1Q61456 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,15■■■□□ 2,74
Ccna1Q61456 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Ccna1Q61456 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,98■■■□□ 2,71
Ccna1Q61456 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Ccna1Q61456 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Ccna1Q61456 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Ccna1Q61456 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Ccna1Q61456 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,78■■■□□ 2,68
Ccna1Q61456 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,68■■■□□ 2,66
Ccna1Q61456 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Ccna1Q61456 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Ccna1Q61456 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31,61■■■□□ 2,65
Ccna1Q61456 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Ccna1Q61456 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Ccna1Q61456 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Ccna1Q61456 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Ccna1Q61456 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Ccna1Q61456 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Ccna1Q61456 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Ccna1Q61456 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,53■■■□□ 2,64
Ccna1Q61456 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Ccna1Q61456 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,39■■■□□ 2,62
Ccna1Q61456 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,37■■■□□ 2,61
Ccna1Q61456 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,37■■■□□ 2,61
Ccna1Q61456 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Ccna1Q61456 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Ccna1Q61456 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Ccna1Q61456 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Ccna1Q61456 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Ccna1Q61456 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31,28■■■□□ 2,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61,7 ms