Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40,34■■■■■ 4,05
Pate1E9Q658 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Pate1E9Q658 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
Pate1E9Q658 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35,29■■■■□ 3,24
Pate1E9Q658 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Pate1E9Q658 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,97■■■■□ 3,19
Pate1E9Q658 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34,59■■■■□ 3,13
Pate1E9Q658 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Pate1E9Q658 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Pate1E9Q658 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Pate1E9Q658 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,9■■■■□ 3,02
Pate1E9Q658 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Pate1E9Q658 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,65■■■□□ 2,98
Pate1E9Q658 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Pate1E9Q658 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Pate1E9Q658 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Pate1E9Q658 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,85■■■□□ 2,85
Pate1E9Q658 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Pate1E9Q658 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Pate1E9Q658 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32,56■■■□□ 2,8
Pate1E9Q658 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32,55■■■□□ 2,8
Pate1E9Q658 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Pate1E9Q658 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32,38■■■□□ 2,77
Pate1E9Q658 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Pate1E9Q658 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Pate1E9Q658 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,3■■■□□ 2,76
Pate1E9Q658 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Pate1E9Q658 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Pate1E9Q658 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,15■■■□□ 2,74
Pate1E9Q658 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,14■■■□□ 2,74
Pate1E9Q658 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Pate1E9Q658 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Pate1E9Q658 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Pate1E9Q658 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Pate1E9Q658 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,85■■■□□ 2,69
Pate1E9Q658 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31,73■■■□□ 2,67
Pate1E9Q658 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Pate1E9Q658 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,56■■■□□ 2,64
Pate1E9Q658 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Pate1E9Q658 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Pate1E9Q658 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Pate1E9Q658 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,17■■■□□ 2,58
Pate1E9Q658 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Pate1E9Q658 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Pate1E9Q658 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Pate1E9Q658 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Pate1E9Q658 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,96■■■□□ 2,55
Pate1E9Q658 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,94■■■□□ 2,54
Pate1E9Q658 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Pate1E9Q658 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Pate1E9Q658 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30,81■■■□□ 2,52
Pate1E9Q658 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,79■■■□□ 2,52
Pate1E9Q658 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Pate1E9Q658 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Pate1E9Q658 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,66■■■□□ 2,5
Pate1E9Q658 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,56■■■□□ 2,48
Pate1E9Q658 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Pate1E9Q658 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Pate1E9Q658 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Pate1E9Q658 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Pate1E9Q658 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30,39■■■□□ 2,46
Pate1E9Q658 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Pate1E9Q658 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,35■■■□□ 2,45
Pate1E9Q658 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30,33■■■□□ 2,45
Pate1E9Q658 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Pate1E9Q658 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Pate1E9Q658 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Pate1E9Q658 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Pate1E9Q658 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Pate1E9Q658 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,14■■■□□ 2,42
Pate1E9Q658 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,14■■■□□ 2,41
Pate1E9Q658 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Pate1E9Q658 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Pate1E9Q658 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Pate1E9Q658 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Pate1E9Q658 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Pate1E9Q658 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Pate1E9Q658 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Pate1E9Q658 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Pate1E9Q658 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Pate1E9Q658 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Pate1E9Q658 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Pate1E9Q658 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29,9■■■□□ 2,38
Pate1E9Q658 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,89■■■□□ 2,38
Pate1E9Q658 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Pate1E9Q658 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,85■■■□□ 2,37
Pate1E9Q658 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,85■■■□□ 2,37
Pate1E9Q658 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Pate1E9Q658 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Pate1E9Q658 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Pate1E9Q658 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Pate1E9Q658 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Pate1E9Q658 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Pate1E9Q658 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Pate1E9Q658 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,33
Pate1E9Q658 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Pate1E9Q658 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29,59■■■□□ 2,33
Pate1E9Q658 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Pate1E9Q658 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29,5■■■□□ 2,31
Pate1E9Q658 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,5■■■□□ 2,31
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