Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
Nptx2O70340 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Nptx2O70340 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Nptx2O70340 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Nptx2O70340 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Nptx2O70340 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Nptx2O70340 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Nptx2O70340 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Nptx2O70340 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Nptx2O70340 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Nptx2O70340 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Nptx2O70340 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Nptx2O70340 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Nptx2O70340 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Nptx2O70340 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
Nptx2O70340 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Nptx2O70340 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Nptx2O70340 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Nptx2O70340 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Nptx2O70340 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Nptx2O70340 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Nptx2O70340 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Nptx2O70340 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Nptx2O70340 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Nptx2O70340 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Nptx2O70340 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Nptx2O70340 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Nptx2O70340 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Nptx2O70340 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Nptx2O70340 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Nptx2O70340 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Nptx2O70340 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Nptx2O70340 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Nptx2O70340 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Nptx2O70340 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Nptx2O70340 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Nptx2O70340 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Nptx2O70340 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nptx2O70340 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Nptx2O70340 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nptx2O70340 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nptx2O70340 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Nptx2O70340 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Nptx2O70340 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Nptx2O70340 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nptx2O70340 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nptx2O70340 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Nptx2O70340 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Nptx2O70340 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Nptx2O70340 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nptx2O70340 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nptx2O70340 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nptx2O70340 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Nptx2O70340 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Nptx2O70340 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Nptx2O70340 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Nptx2O70340 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Nptx2O70340 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nptx2O70340 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Nptx2O70340 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Nptx2O70340 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nptx2O70340 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nptx2O70340 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Nptx2O70340 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nptx2O70340 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Nptx2O70340 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nptx2O70340 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Nptx2O70340 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nptx2O70340 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Nptx2O70340 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Nptx2O70340 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nptx2O70340 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nptx2O70340 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Nptx2O70340 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Nptx2O70340 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Nptx2O70340 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Nptx2O70340 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Nptx2O70340 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nptx2O70340 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nptx2O70340 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nptx2O70340 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Nptx2O70340 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Nptx2O70340 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Nptx2O70340 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Nptx2O70340 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Nptx2O70340 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Nptx2O70340 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Nptx2O70340 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Nptx2O70340 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Nptx2O70340 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Nptx2O70340 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Nptx2O70340 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Nptx2O70340 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Nptx2O70340 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nptx2O70340 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nptx2O70340 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nptx2O70340 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nptx2O70340 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nptx2O70340 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nptx2O70340 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms